食管与贲门双源癌蛋白质指纹模型的建立及肿瘤标志的筛选
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下一篇 2009-01-01 19:36:45/ 个人分类:蛋白质
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【摘要】 目的:建立食管与
贲门双源癌的
蛋白质组指纹诊断模型,筛选食管贲门双源癌相关蛋白,为建立食管贲门双源癌
肿瘤标志提供理论基础。方法:采用表面增强激光解吸离子化飞行时间
质谱仪(SELDI2TOF2MS)
技术对19 例食管贲门双源癌(双源癌组)和50 位健康人(对照组)的血清进行蛋白质组的对比研究。根据差异性蛋白质的质核比(相对分子质量) 从SWISS2PROT 蛋白质数据库中筛选并确定相关候选蛋白和
基因。并通过RT2PCR 方法进一步
分析这些关键候选基因在食管贲门双源癌组织中表达变化特征。结果:以相对分子质量21866 21 ×103 、51103 30 ×103 、61597 65 ×103 、71931 55 ×103 、91311 96 ×103 和41113 99 ×103 的6 种蛋白质组成的决策树模型对双源癌组诊断的准确率、敏感度和特异度分别为78126 %、73168 %和80 %。相对分子质量为51340 52 ×103 和51921 32 ×103 的蛋白质查询结果为COX7c 及Beta2defensin212223 ,在双源癌的食管癌组织和贲门癌组织的阳性率分别为60 %(3/ 5) 、60 %(3/ 5) 、60 %(3/ 5) 和40 %(2/ 5) ,对照组食管和贲门正常上皮组织均为阴性。结论:以相对分子质量21866 21 ×103 、51103 30 ×103 、61597 65 ×103 、
71931 55 ×103 、91311 96 ×103 和41113 99 ×103 的6 种蛋白质组成的决策树模型,可作为食管贲门双源癌的蛋白诊断模型,COX7c 及Beta2defensin212223 与食管贲门双源癌密切相关,为食管贲门双源癌肿瘤标志筛选提供重要线索。
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TAG: 光谱法生物学肿瘤肿瘤标记蛋白质组学多原发性贲门