食管与贲门双源癌蛋白质指纹模型的建立及肿瘤标志的筛选

上一篇 / 下一篇  2009-01-01 19:36:45/ 个人分类:蛋白质

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【摘要】 目的:建立食管与贲门双源癌的蛋白组指纹诊断模型,筛选食管贲门双源癌相关蛋白,为建立食管贲门双源癌肿瘤标志提供理论基础。方法:采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SELDI2TOF2MS) 技术对19 例食管贲门双源癌(双源癌组)和50 位健康人(对照组)的血清进行蛋白质组的对比研究。根据差异性蛋白质的质核比(相对分子质量) 从SWISS2PROT 蛋白质数据库中筛选并确定相关候选蛋白和基因。并通过RT2PCR 方法进一步分析这些关键候选基因在食管贲门双源癌组织中表达变化特征。结果:以相对分子质量21866 21 ×103 、51103 30 ×103 、61597 65 ×103 、71931 55 ×103 、91311 96 ×103 和41113 99 ×103 的6 种蛋白质组成的决策树模型对双源癌组诊断的准确率、敏感度和特异度分别为78126 %、73168 %和80 %。相对分子质量为51340 52 ×103 和51921 32 ×103 的蛋白质查询结果为COX7c 及Beta2defensin212223 ,在双源癌的食管癌组织和贲门癌组织的阳性率分别为60 %(3/ 5) 、60 %(3/ 5) 、60 %(3/ 5) 和40 %(2/ 5) ,对照组食管和贲门正常上皮组织均为阴性。结论:以相对分子质量21866 21 ×103 、51103 30 ×103 、61597 65 ×103 、
71931 55 ×103 、91311 96 ×103 和41113 99 ×103 的6 种蛋白质组成的决策树模型,可作为食管贲门双源癌的蛋白诊断模型,COX7c 及Beta2defensin212223 与食管贲门双源癌密切相关,为食管贲门双源癌肿瘤标志筛选提供重要线索。



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TAG: 光谱法生物学肿瘤肿瘤标记蛋白质组学多原发性贲门

 

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