细胞核染色体dna基因的关系
2020.1.31
实验方法：
环状dna-seq
rna-seq
（云序生物提供以上服务）
1. ecdna是环状结构
为了了解ecdna的结构，作者通过
环状dna-seq
（云序生物提供以上服务）方法研究了三种人类癌细胞系和来自于tcga的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了gbm39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外，并且超高分辨率共聚焦显微镜下能够观察这些扩增子环状结构。
图1 ecdna是环状结构
2.eccdna驱动大量癌基因表达
为了研究eccdna对转录的影响，作者又对样品进行了
rna-seq
（云序生物提供此项服务），并将dna-seq数据与rna-seq数据进行联合分析。发现eccdna是癌基因中表达丰度最高的基因之一。作者在dna-seq和rna-seq数据中分析了单核苷酸多态性，进一步区分了转录本来源（eccdna还是原染色体），发现eccdna编码的转录本大量增加。这......
......
揭示DNA甲基化与基因沉默的关系
DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关，但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6
染色体核型分析与基因芯片的区别
检测条件不同 核型分析需要新鲜的“活细胞”，需要细胞培养，若细胞培养失败，则检测失败，并且细胞生长周期比较长，因此核型分析的报告周期比较长。 基因芯片检测对象为DNA，不需要细胞培养，成功率高，报告周期短。 检测分辨率不同
三维基因组（Hi-C）技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得
英国剑桥大学首次报道DNA真实3D结构
conformation capture），以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获，获得高分辨率的染色质三维结构信息，如今的
羊水穿刺染色体核型分析和羊水基因芯片检查的区别
羊水穿刺染色体核型分析和羊水基因芯片检查有以下区别：1、两种方法医学目的不同羊水穿刺染色体核型分析核型分析是了解有没有染色体数目异常，了解有没有唐氏儿之类的疾病，而基因片段羊水穿刺是用来检查胎儿是否畸形。基因芯片则是检查胎儿的DNA，了解
染色体外环状DNA（eccDNA）
%），以及sRNA（8.1%）部分是最经典的成环结构，大量的环能够匹配到这些区域。图2 eccDNA长度分布和来源多样性3.eccDNA基因组分布前文提到99% eccDNA小于25Kb，作者分别探索这些eccDNA来源于哪些染色体。结果显示所有染色体
细胞核转染技术原理、步骤及应用
、原代细胞等难转染细胞。2.高转染效率，直接将外源基因转入核内。在某些细胞中Nucleofector的转染效率可以达到90%，与病毒感染同样有效。Nucleofector直接将DNA运送到细胞核中，因此，基因表达就可以立即开始，数小时内
一个高质量的黄连染色体规模的基因组组装和注释
the diversification of protoberberine-type alkaloids”的研究论文，该研究提出了一个高质量的黄连染色体规模的基因组组装和注释。系统发育和比较基因组分析揭示了该物种的系统发育位置，并确定了毛茛科共有的单轮古代
微阵列—比较基因组杂交技术检测染色体异常
、有序的分子微阵列。然后，从测试标本中提取DNA，将测试DNA和参考DNA用不同的荧光色素标记，杂交到微阵列上，通过检测这两种荧光色素的比率，了解待测标本基因拷贝数的变化。其能够检测染色体亚微结构异常。微阵列技术已成为一个重要的工具，用于
进行CGH分析具有敏感度高、精确度高、分辨率高（平均分辨率1.4kb）的特点，同时还可检测福尔马林固定的石蜡样品，实验数据可信度高，仅需1.5μg基因组DNA即可进行实验。 具体产品特点
● DNA120-OP 适用溶剂及混合溶剂：氨水、异丙醇和 PCR 缓冲液（水性）● 典型应用 -DNA120：电泳或芯片分析前 DNA/RNA 样品制备、荧光染料标记 cDNA、水性溶剂中 PCR 样品的干燥● 典型应用 -DNA120-OP：干燥氨水中的合成寡核苷酸
Thermo Scientific™ Savant™ DNA120 和 DNA120-OP;型号 DNA12O-OP SpeedVac kit
高：一个反应中可同步检测多至40个基因。 灵敏度高：能够检测0.5倍基因表达量变化，具有无可比拟的线性关系（0.5倍递增稀释，R2>0.99）。 低样本起始量：只需要5-50ng 总RNA 或DNA
