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Cell重大成果:绘制癌症药物基因组互作景观图

2016.7.08

  在发表于7月7日《细胞》(Cell)杂志上的一项研究证实,患者来源的癌细胞系中包含存在于患者肿瘤中大多数同样的遗传改变,可以利用来了解肿瘤对新药可能产生的反应,提高开发新型个体化癌症疗法的成功率。

  由来自韦尔科姆基金会桑格研究所、欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)和荷兰癌症研究所的科学家们领导的这项国际研究,发现了患者癌症样本中许多的突变与对特定药物的敏感性之间的强关联性。这有可能通过生成一些研究结果来帮助医生预测针对每位患者可获得的最佳药物,或最适合的临床试验来推动个体化癌症医疗。

  在组合了来自患者、实验室癌细胞系和药物敏感性分子数据的第一个系统的、大规模研究中,研究人员在29种不同肿瘤类型的11,000个患者样本中研究了已知致癌的一些遗传突变。

  他们建立了患者中致癌遗传改变的目录,将这些改变映射到1000个癌细胞系中。接下来,他们测试了这些细胞系对265种不同癌症药物的敏感性,以了解其中的哪些遗传改变影响了药物敏感性。

  研究人员生成了两个重大发现。第一,存在于患者癌症中的大多数分子异常也存在于实验室的癌细胞中。这意味着细胞系确实是鉴别哪些药物将对患者发挥最 好疗效的有用模型。第二,在数千患者癌症样本中检测到的分子异常,对于一种特定药物是否影响癌细胞的生存可单独或联合产生重大的影响。

  研究结果表明,可以更好地利用癌细胞系来了解哪些药物将为哪些患者提供最有效的治疗。

  韦尔科姆基金会桑格研究所该研究的联合领导者Mathew Garnett说:“在这项研究中,我们比较了患者肿瘤与实验室培养的癌细胞的遗传景观。我们发现癌细胞携带了在患者中驱动癌症的相同遗传改变。这意味着 可以利用对细胞系的药物敏感测试来阐明肿瘤对一种药物有可能产生的反应。”

  以往的一些研究已测序了来自患者的癌症DNA,以鉴别驱动癌细胞生物学的分子异常。研究人员还证实可以利用实验室中培育的大量癌细胞系来检测对数百种药物的敏感性。然而,这是第一项研究系统地组合这两组信息。

  论文的共同第一作者、EMBL-EBI和桑格研究所博士后研究员Francesco Iorio博士说:“如果一种细胞系具有与患者肿瘤相同的遗传特征,且这一细胞系响应一种特定的药物,我们就可以将新研究的焦点放在这一研究发现上。这有 可能最终帮助基于他们有可能对治疗产生的反应将癌症患者分配到更准确的组群中。这一资源可以真正地帮助癌症研究。最重要地是,可以利用它来为医生创造一些 工具,为他们的癌症患者选择最有前景的临床试验。尽管这仍然是很遥远的事情,但我们正在朝着正确的方向前进。”

  韦尔科姆基金会桑格研究所该研究的联合领导者Ultan McDermott博士说:“我们需要更好的方法在开展复杂和昂贵的临床试验之前,弄清楚哪些组群的患者更有可能对一种新药产生反应。我们的研究表明,癌 细胞系确实能捕捉存在于肿瘤中的分子改变,因此可以预测肿瘤将对药物产生的反应。这意味着在我们尝试在患者中测试一种新药之前,细胞系可以告诉我们更多肿 瘤可能产生的反应的信息。我们希望这一信息将最终帮助设计出一些临床试验针对最有可能从治疗中受益的那些患者。”

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