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【探访实验室】加州大学欧文分校利用噬菌体对抗 ESKAPE 感染
抗菌药物耐药性 (AMR) 是一个全球性的问题，尤其是在治疗一组具有多重耐药性的高致病性细菌时，这组高致病菌包括屎肠球菌 (E)、金黄色葡萄球菌 (S)、肺炎克雷伯菌 (K)、鲍曼不动杆菌 (A)、铜绿假单胞菌 (P) 和肠杆菌属 (E)，统称 ESKAPE，也就是我们常说的六大超级细菌。
加州大学欧文分校 (UCI) 生物科学学院分子生物学和生物化学系的 Katrine Whiteson 博士的实验室致力于研究个体和持久性微生物以及病毒群落对人类健康的影响。研究了包括利用噬菌体作为必不可少的 ESKAPE 疗法和药物的替代品的可行性，因为噬菌体可是细菌的天敌！
8月24日，Katrine Whiteson 博士通过网络研讨会，分享了她的研究以及如何通过高通量方法来评估宿主特异性，研讨会回放——【网络研讨会】噬菌体作为抗生素的替代品研究
噬菌体模式图
(图片来源：Agilent 官网)
与传统的抗生素不同，噬菌体具有高度的宿主特异性，因此，对噬菌体治疗的研究工作必须包括对噬菌体及其宿主相互作用的急性表征。Whiteson 实验室进行了详细的噬菌体研究，包括提高噬菌体破坏细菌效率的方法。
在她的实验室里，Alisha Monsibais 和 Andrew Saghir 是这个充满活力的团队中的成员，他们负责这项研究中大量的检测实验，包括液体宿主范围、感染多样性 (MOI) 生长曲线分析、噬菌体动力学检测、宏基因组学、宏转录组学、代谢组学、抗生素协同作用等。
综合大量实验结果，他们将研究发现和见解分享给他们的合作伙伴——加州大学圣地亚哥分校医学院创新噬菌体应用和治疗中心 (IPATH)，请他们将这些复杂的信息转化为临床相关性。
Andrew说：
“从治疗的角度来看，噬菌体宿主特异性对对抗ESKAPE感染特别有益，但在实验室中，当我们通过生长曲线来确定潜在的治疗候选者时，噬菌体宿主特异性却增加了实验的复杂性，我们需要提高样品通量，以充分了解这些噬菌体以及它们在环境中的相互作用。”
而他们现有的酶标仪使这个研究的复杂性进一步增加了，因为一台酶标仪一次只能读取一块孔板，近二十年来都使如此。如果要进行多块孔板（提高了通量）的平行实验就需要同时使用多台酶标仪，这无疑又增加了数据的变异风险。Andrew 还指出，因为需要使用多台酶标仪同时检测，因此任何一个酶标仪故障都将导致实验失败，使实验室生产力戛然而止。
为了提高实验室噬菌体的研究效率，Alisha 在寻找合适的微孔板检测仪时，安捷伦 BioTek LogPhase 600 微生物检测仪引起了她的注意。除了一次可读取多达四个标准 96 孔板外，LogPhase 600 还提供 5 个固定波长和高达 45ºC 的温度控制。
Alisha说：
“在网上看完 LogPhase 600 的视频后，我真的很兴奋，我们使用 DEMO 机测试了几个月，这使我们能够在工作中看到微孔板检测仪的实际运行情况，最终为我们敲定了这笔交易。”
除了高度评价 LogPhase 600 之外，Alisha 还赞扬了为他们提供技术支持的安捷伦 BioTek 员工，指出他们非常友好，坦率，并且对仪器演示和预防性维护都非常专业。
Whiteson 实验室的几位研究人员几乎每天都在使用 LogPhase 600，进行从 24 小时到一周时间不等的动力学研究。LogPhase 600 因为有 4 个板位的通量、实验条件一致性和产生的数据质量而备受赞誉。
Andrew指出：
“生长曲线是我们研究的基础，因此拥有 LogPhase 600 可以帮助我们获得比以前更多的数据，提高效率。”
Alisha补充道：
“我对 LogPhase 600 非常满意，因为它易于使用，培训其他人也非常简单，它提高了我们的数据输出速度，我们可以在它上面预定实验时间，这样每个人的项目都可以向前推进，以实现实验室的目标。”
Katrine Whiteson 博士实验室团队
（后排左起：Katherine McCarthy, Allene Vo, Olivia Tea, Coby Fan，Eric Adams, Andrew Saghir；Alisha Monsibais前排左起：Jennifer Godinez Phan, Karen Lam）
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关于 BioTek
BioTek 是世界领先的多功能微孔板检测仪及软件的研发生产公司，拥有 54 年的悠久历史。BioTek 的 Synergy 系列多功能微孔板检测仪拥有灵活的功能配置和优异的检测结果，配合友好强大的操作软件，为广大用户提供了便捷高效的使用体验。服务科学，促进科学始终是我们追求的目标。2019 年 BioTek 加入安捷伦科技有限公司，成为细胞分析事业部的重要组成成员。
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