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定量甲基化修饰组学

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参考报价: 面议 型号: 定量甲基化修饰组学
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

蛋白质甲基化修饰(Methylation)是表观遗传学的重要研究内容之一。甲基化多发生在转录因子和核蛋白质上,也有少量胞质蛋白会发生。甲基化可发生在精氨酸(R)和赖氨酸(K)上,包括单甲基化、非对称二甲基化/对称二甲基化、三甲基化等多种形式。精氨酸甲基化参与转录调控,介导DNA损伤修复。赖氨酸甲基化可调控组蛋白功能,参与基因转录的表观调控。 利用针对不同甲基化位点和修饰形式的基序抗体对甲基化肽段富集后,再用LC-MS/MS分析,实现大规模甲基化蛋白质定性定量分析。

技术原理

目前用于甲基化蛋白质组分析的甲基化肽段富集抗体分为精氨酸甲基化(Me-R)抗体和赖氨酸甲基化(Me-K)抗体两大类。根据氨基酸残基上所含甲基化修饰基团数量的不同,精氨酸甲基化(Me-R)抗体又包括:单甲基化精氨酸(MMA)抗体、非对称二甲基化精氨酸(ADMA)抗体和对称二甲基化精氨酸(SDMA)抗体;赖氨酸甲基化(Me-K)抗体又包括:赖氨酸单甲基化(K-Me)抗体、赖氨酸二甲基化(K-2Me)抗体和赖氨酸三甲基化(K-3Me)抗体。其中,Me-R的各类抗体需要单独使用,而Me-K抗体可以混合使用。

技术优势

  • 采用抗体,特异性高;

  • 鉴定通量高, 一次可检测最高可达上千个甲基化修饰位点。

应用领域

  • 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等;

  • 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等;

  • 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等;

  • 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等;

  • 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等;

  • 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等;

  • 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等;

  • 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等。

样品要求

  • 组织类型:动物组织≥100mg、植物组织≥100mg、微生物≥20mg;

  • 细胞样品:每样品细胞量 ≥ 1X107

  • 蛋白提取物:≥100µg

  • 体液:血清/血浆≥200µL、尿液≥1ml、唾液/脑脊液≥1ml、泪液≥1mL、支气管灌洗液≥3ml;

  • 外泌体:≥10µL

  • FFPE石蜡包埋切片:≥0.3 mm * 0.3 mm

参考文献

[1]. Guo, A. et al. (2014) Immunoa nity enrichment and mass spectrometry analysis of protein methylation. Mol. Cell. Proteomics 13(1) 372–387.

[2]. Sylvestersen, K. B. et al. (2014) Proteomic analysis of arginine methylation sites in human cells reveals dynamic regulation during transcriptional arrest. Mol. Cell. Proteomics 13(8):2072–2088.


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