STR/SSR/微卫星分析

STR/SSR/微卫星分析

微卫星标记（Microsatellite）也称为短串联重复序列（STR）或简单重复序列（SSR），是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星中重复单位的数目存在高度变异，这些变异表现为微卫星数目的整倍性变异或重复单位序列变异，因而造成多个位点的多态性。STR/SSR 标记能很好地将这些变异揭示出来，不同的STR/SSR 在不同品种甚至个体间可具有多态性。

技术路线

技术优势

收样要求

技术服务

● STR 引物开发

对于还没有完成全基因组测序，基因组信息缺失的物种，进行STR/SSR 研究时需要进行引物开发。所选取的STR 位点要求是多态性高、长度适中的基因区域。随着二代测序成本的不断降低和适用性的提升，已经替代传统的磁珠富集方法成为STR 引物开发的关键方法，基于二代测序基因序列的数据，可以筛选到合适的STR 区域，并设计引物。

● 引物筛选

对于已经具有大量STR 引物，或STR 位点信息的客户来说，不必要做引物开发，可以进行引物筛选与优化。引物筛选即多态性引物筛选，是从大量STR 引物中筛选出多态性好、长度适中、扩增表现好的引物的过程。进行大量引物筛选是一项繁重的工作，我公司自主研发出M13 加尾通用型引物，适用于任何物种，可大幅降低客户的成本。根据客户需求，我们会筛选出指定数量的合格引物。

● 单重与多重样本扩增

在进行引物开发、引物筛选与优化之后，已经取得一组多态性好、效果好的STR 引物，可对单一STR 基因座进行扩增检验。然而，一般STR/SSR 研究在这一步涉及大量样本检测或产品化，因此需要根据需求进行能对多个基因座同时检测的多重STR 扩增体系的设计和条件摸索。阅微基因具有多款基于STR 检测的法医案件/ 建库试剂盒及临床肿瘤/ 生殖筛查相关试剂盒，拥有丰度的多重扩增体系建立经验。

● 数据深度解析与个性化定制分析

除了可以用GeneMapper 软件分析测序仪下机文件，编制panel 和bin 等文件，生成定制的可视化结果之外，还可以利用各类生物信息学软件（POPGENE, MEGA, Joinmap, Structure 等）对上述数据进一步分析，例如绘制遗传连锁图谱、关联分析和遗传多样性分析等。

完成物种 

       高粱、玉米、燕麦、小麦、棉花、苹果、葡萄、甘蔗、梨、桃、梅、杏、猕猴桃、草莓、枣、樱桃、茶叶、枸杞、豇豆、扁豆、棘豆、牡丹、茶花、蝴蝶兰、芍药、菊花、石榴、榕树、紫鹃、重楼、柳树、松茸、飞机草、长角扁谷盗、鲈鲤、食蟹猴、大熊猫等。

知名合作单位 

● 微卫星检测：北大人民医院、北大医学部遗传系、北京林业大学、北京首都儿科研究所、北医三院、北京协和医院、北京博友新创生物技术、贝瑞和康、北京爱根生物、成都大熊猫繁育基地、东北林业大学、复旦大学、军科院五所、江西九江学院生命科学学院、华中农业大学、解放军306 医院、河北农业大学、鲁东大学、上海市儿科医学研究所、上海交大医学院附属新华医院、四川大学生命科学院、深圳仙湖植物园、天一辉远生物科技有限公司、无锡汇泽基因、西双版纳植物园、西南民族大学、中科院昆明植物所、中科院蜜蜂所、中科院动物所、中科院微生物所、中国农科院蔬菜花卉所、中日楼、环发所、中央民族大学、中国农业大学、中科院成都生物所、中国疾病预防控制中心；

● 微卫星扩增体系构建：北大人民医院、北大肿瘤医院、北京工业大学、第三军医大学、福建甘蔗研究所、解放军总医院第一附属医院、解放军306 医院、南京脑科医院、青海大学、全国畜牧总站、西双版纳热带植物研究所、湘雅医院、中国农业大学、中国医学科学院实验动物研究所、中国科学院遗传所、水生生物研究所、中国农科院棉花研究所、中国林业科学院、中国水产科学研究院、浙江海洋学院、湛江海兴农海洋生物

● AFLP：北京交通大学、河北农业大学、中科院昆明植物所、中国农科院；

● 细胞鉴定：昂赛细胞基因工程、安集协康生物技术、北大人民医院、北京大学医学部、百济神州生物科技、博雅辑因生物科技、博雅未名联合干细胞、重庆医科大学、第三军医大学西南医院、亘喜生物科技、恒瑞医药、汉氏联合生物技术、哈尔滨医科大学、康龙化成新药技术、科兴疫苗技术、南开大学、瑞鹿生物技术、上海交大瑞金医院、苏州大学、山东大学齐鲁医院、斯丹赛生物技术、天津医科大学、武汉大学中国典型培养物保藏中心、义翘神州生物技术、中国科学院上海细胞库、中国食品药品检定研究院、中国协和医科大学、中科院微生物所、中科院上海药物研究所、中国农业大学、中山大学附属肿瘤医院、中南大学、中国人民解放军空军军医大学。

STR/SSR/微卫星分析信息由北京阅微基因技术有限公司为您提供，如您想了解更多关于STR/SSR/微卫星分析报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途