基于转录组表达谱的进化分析

RSAM-18 转录组进化分析：基于转录组表达谱的进化分析

对转录组进化可以进行综合系统生物学分析。主要可从序列分析方式与基因表达量证据两者分别进行分析。（1）序列分析可以从（a）多物种转录组整体性同源基因层面分析进化速率，进而分析正向选择或负向选择趋势的基因；（b）序列分析也可以从可变剪切角度分析转录组进化的证据；另外，基因表达量是转录组的重要证据，进化分析可从转录组表达谱计算表达量距离进而判断进化距离。

本方案计算物种间转录组表达模式，采用PCA主成性分析技术对多物种样本特征进行选取和分离。对多物种全局转录组的表达谱，通过计算全局表达距离矩阵（expression distance matrices）构建表达谱系统发生树（gene expression trees）。本方案将采用元分析（meta-analysis）技术评估基于表达谱距离的进化树与基于序列方式计算获取的进化树的一致性（homogeneity）或异质性（heterogeneity）。 
 

更多详情：http://www.biogenius.cn/htm/products/transcriptome/rnaseq/analysis/319.html

 

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