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变性条件下的凝胶电泳实验——梯度胶凝胶电泳

2019.3.29
实验方法原理在凝胶电泳中使用丙烯酰胺梯度胶比使用线性胶有两大优点。一是在高浓度丙烯酰胺条件下可以增加蛋白质的分子筛作用,从而使低分子量蛋白质形成淸晰的条带。另一是梯度胶可以在块胶内分离分子量范围更大的蛋白质(如 5%~20% 的凝胶可以分离 15 kDa~200 kDa 的蛋白质;而 3%~30% 的凝胶可以分离 13~950 kDa 的蛋白质)。丙烯酰胺在梯度胶中的百分比可根据需要来定。
实验材料

蛋白质溶液

仪器、耗材

梯度仪蠕动泵连接管

实验步骤

1. 工作溶液


1.1.1 溶液 A

30% 丙烯酰胺,0.8% 双丙烯酰胺


1.1.1 溶液 B

15 mol/L Tris-HCl(pH 8.8),0.4% SDS


1.1.3 溶液 C

0.5 mol/L Tris-HCl(pH 6.8),0.4% SDS


2. 5%~20% 分离胶所需的溶液量


3. 制备分离胶

灌制丙烯酰胺梯度胶与线性胶最大的区别在于需要使用梯度仪。恰好在分离胶溶液灌入凝胶模具之前,梯度仪将高浓度和低浓度的丙烯酰胺溶液相混合,在没有蠕动泵的情况下,凝胶溶液依靠重力灌入模具内。高浓度丙烯酰胺溶液内加入蔗糖可以稳定梯度的形成。


3.1 准备好凝胶模具,并装配好梯度混合器。磁力搅拌器置于梯度混合器的下方,这样就不会使混合器的凝胶槽内产热。调节蠕动泵至流速为 3 ml/min;


3.2 准备好未加 TEMED 的分离胶溶液;


3.3 将 TEMED 加至分离胶溶液内,轻轻搅拌混匀,此时动作要迅速,因为凝胶很快会聚合;


3.4 将适量的两种分离胶溶液分别加人到混合器的两个凝胶槽中(例:对于 10 ml 的凝胶,各加 5 ml 至每个槽屮高百分比浓度的丙烯酰胺溶液应加入至 B 槽中;


3.5 打开磁力搅拌器,接通两个槽之间的连通管;


3.6 打开蠕动泵,形成梯度胶;


3.7 当分离胶灌完后,在胶的顶部轻轻覆盖约 1~5 mm 的水层;


3.8 用清水冲洗梯度混合器和连接管,防止残留的丙烯酰胺聚合后堵塞;


3.9 堆积胶的制备。(参见SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳)

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注意事项

1. 堵塞在连通管中或梯度仪凝胶槽中的气泡致使形成的梯度不均一。


2. 凝胶溶液放在冰箱 4℃ 预冷,可以延缓灌胶时凝胶聚合的时间。


3. 为了延缓梯度凝胶聚合的时间,可用核黄素來替代过硫酸铵。核黄素的终浓度为 0.0005%(储存液浓度为 0.004%),将凝胶暴露于日光,或白色、蓝色的荧光下即可聚合。


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