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ABI 3730XL测序平台的原理及特点

2020.7.06

Applied Biosystems 3730XL测序仪是高质量的长片段读取和序列分析的测序平台,应用灵活而广泛。3730XL可同时分析96个样品,该仪器采用4色荧光同时检测,可不间断24小时运行,自动灌胶,上样,电泳分离,检测及数据分析。本仪器除了能够完成新基因测序工作或比较测序工作外,还可进行多种片段分析,包括微卫星 DNA 分析,比较基因型分析,单核苷酸多态性 (SNP) 研究等。

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ABI 3730XL测序仪

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测序峰图

双脱氧链终止法原理

    双脱氧链终止法又称为Sanger法,其原理是DNA模板在DNA聚合酶、引物、四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)存在下进行复制时,在四管反应体系中分别按一定的比例引入四种双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3’-OH基团,当ddNTP掺入链的末端时,该链就会停止延伸。如此每管反应体系中就产生了一系列长度不等的以ddNTP为3’端的DNA片段。反应终止后,分4个泳道进行凝胶电泳以分离长短不一的DNA片段,相邻的片段长度相差一个碱基。经放射自显影后,根据片段3’端的双脱氧核苷,便可获得合成片段的碱基排列顺序。

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Sanger法测序原理图

 

ABI 3730XL测序仪技术原理

ABI 3730XL自动测序仪是基于毛细管电泳和荧光标记技术的DNA测序仪。基于Sanger法,3730XL测序仪拥有96道毛细管,并用荧光标记代替了同位素标记,从而大大提高了DNA测序的速度和准确性。4种双脱氧核苷酸(ddNTP)的碱基分别用不同的荧光进行标记,在通过毛细管时不同长度的DNA片段上的4种荧光基团被激光激发,发出不同颜色的荧光,被CCD检测系统识别,并直接翻译成DNA序列。

仪器特点

1. 双光束双侧激光激发,光栅分光装置和后置超薄CCD检测成像系统。

2. 自动灌胶、上样、电泳分离、检测及数据分析,可连续运行24小时无需人工干预。

3. 一次电泳测定96个样品,一天可跑12次测序电泳,每天的测序产率是1152个样品。

4. 自动碱基识别、基因型分析与质量评分判定。

5. 最新POP-7液体分离胶,动态内镀毛细管壁,使读序长度达1000bp以上,精确读序达800bp。

6. 良好的温控装置提供了更大的温控范围(18~70℃),电泳温度可达70℃,有助于去除二级结构的影响。

7. 高灵敏度减少DNA和测序试剂的使用量。

8. 更高的自动化减少劳力成本及人为失误的成本。

技术应用

1. 菌液、质粒、PCR产物测序

2. Fosmid/Cosmid/BAC双末端测序

3. 大片段鸟枪法测序

4. EST测序和分析

5. 步移测序

6. SNP发现和重测序

7. STR分型



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