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DNA琼脂糖凝胶电泳原理和操作

2020.9.08

【原理】

DNA的电泳原理与蛋白质电泳基本相同。在pH高于其pI时,DNA分子带负电荷。在直流电场中DNA向正极泳动。不同的DNA分子因电荷数、构象和分子量大小的不同,在同一电泳系统中的泳动速度有差异,达到分离的目的。电泳后的凝胶浸泡于溴化乙锭染料中,溴化乙锭分子与DNA分子结合,在紫外线照射下显出荧光,可对DNA进行定性或定量检测。

【操作】

1.凝胶板的制备 取有机玻璃内槽,洗净、晾干。用橡皮膏(宽约1cm)将有机玻璃内槽的两端边缘封好(注意,将橡皮膏紧贴在有机玻璃内槽两端边缘,不要留空隙)防止漏胶。将有机玻璃内槽置于一水平位置,放好样品槽模板(梳子)(图7-1),注意为防止胶漏,梳子不要插到底。

2.灌胶:将溶化的琼脂糖凝胶冷却至约65℃时,小心地将凝胶倒入有机玻璃内槽上,控制灌胶速度,使缓慢地展开,直到整个有机玻璃板表面形成均匀的凝胶层(图7-2),凝胶厚度一般为0.3~0.5cm。

3.室温下放置约1小时,待胶凝固完全后,小心剥去两端的橡皮膏,将铺胶的有机玻璃内槽放在电泳槽中,加入0.5*TBE电泳缓冲液,液面高于凝胶面约0.5cm ,轻轻拔出样品槽模板(梳子),在胶板上即形成相互隔开的样品槽。

4.加样:将样品和上样缓冲液1: 6混匀,用微量加样器将样品分别加入胶板的样品小槽内,(注意:加样时应防止加样器头碰坏凝胶孔壁)。

5.电泳:加样完毕后在靠近样品槽一端连接负极,另一端连接正极,接通电源,开始电泳,为防止样品扩散在样品进胶前可用略高电压,当样品进胶后,应控制电压不高于5V/cm(电压值V/电泳槽两极之间距离cm)。当染料条带移动到距离凝胶前沿1cm时,停止电泳。

6.染色:将电泳后的胶板小心推进含溴化乙锭(0.5μg/ml)的染色液中,室温下浸泡约30分钟。

7.观测:小心地取出凝胶并用水轻轻冲洗胶表面的溴化乙锭溶液,将凝胶放在紫外灯观察台上,在波长254nm紫外灯下进行观察。在DNA存在的位置呈现出橘红色荧光,紫外光激发15分钟左右,肉眼可观察到清晰的条带。


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