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从包涵体中纯化表达蛋白

2020.8.10

实验材料 表达靶蛋白的大肠杆菌细胞

试剂、试剂盒 细胞裂解缓冲液 I细胞裂解缓冲液Ⅱ脱氧胆酸浓盐酸包涵体溶解缓冲液 I包涵体溶解缓冲液ⅡKOHPMSFSDS 凝胶加样缓冲液含尿素的 Tris-ClDNaseI溶菌酶SDS-聚丙烯酰胺凝胶

仪器、耗材 Sorvall GSA 转头或相当的转头pH 试纸磨光玻璃棒

实验步骤

材料


缓冲液和溶液


贮存液、缓冲液和试剂的成分请参见附录 1。

贮存液稀释至适当浓度。


细胞裂解缓冲液 I

50 mmol/LTris-Cl(pH8.0)

1mmol/LEDTA(pH8.0)

100 mmol/LNaCl


细胞裂解缓冲液Ⅱ, 冰冷

50 mmol/L Tris-Cl(pH8.0)

10 mmol/L EDTA(pH8.0)

100 mmol/LNaCl

0.5% TritonX-100


脱氧胆酸

使用蛋白级的胆酸/去污剂。


HCl(12mol/L)(浓盐酸)


包涵体溶解缓冲液 I

50 mmol/LTris-Cl(pH8.0)

1 mmol/LEDTA(pH8.0)

100 mmol/LNaCl

8mol/L 尿素

0.1mol/LPMSF

缓冲液现用现配。


包涵体溶解缓冲液Ⅱ

50 mmol/LKH2PO4(pH10.7)

1 mmol/LEDTA(pH8.0)

50 mmol/LNaCl


KOH(10mol/L)


PMSF(100 mmol/L)


1x 和 2XSDS 凝胶加样缓冲液

不含 DTT 的 1x 和 2xSDS 凝胶加样缓冲液室溫保存,lmol/LDTT 贮存液现用现加于上述缓冲液。


含尿素的 Tris-Cl(0.1mol/L,pH8.5)

仅限于方法 2 使用,请见步骤 7。配制内含尿素浓度递增(如 0.5、1、2 和5mol/L) 的 0.1mol/L Tris-Cl(PH8.5)。使用前用固体尿素现用现配,不能使用任何尿素贮存液,因为尿素容易分解。


酶和缓冲液


DNaseI(1 mg/ml)


溶菌酶(10 mg/ml)

用 Tris-Cl(PH8.0) 现用现配。


凝胶


SDS-聚丙烯酰胺凝胶(10%)

用于分离蛋白的 SDS-聚丙烯酰胺凝胶的制备请参考附录 8。


离心机和转头


Sorvall GSA 转头或相当的转头


特别配备


pH 试纸

备用,请见步骤 10。


磨光玻璃棒


载体和细菌菌株


表达靶蛋白的大肠杆菌细胞

培养 1L 以包涵体形式表达靶蛋白的大肠杆菌细胞


方法


制备细胞抽提物


1.1L 表达细胞培养物于预先称重的离心管中 4°C 以 5000 g(5500r/min Sorvall GSA 转头)离心 15 min。

注意:步骤 2~4—定要在 4°C 进行。


2. 吸去上清,称菌体沉淀的重量,每克(湿重)菌体加入 3 ml 细胞裂解缓冲液 I,轻轻旋动或用磨光玻璃棒搅动,使菌体悬起。


3. 每克(湿重)菌体加入 4ul 100 mmol/LPMSF,80ul 10 mg/ml 溶菌酶,搅动 20 min 也可以加入其他蛋白酶抑制剂混和物(见方案 1)。


4. 每克(湿重)菌体加入 4 mg 脱氧胆酸,继续搅动。


5. 悬液 37°C 放置,不时用磨光玻璃棒搅动,待其变黏时每克(湿重)菌体加入 20ul 1 mg/ml DNaseI。


6. 裂解液室温放置,直至不再黏稠(约 30 min)。


纯化和洗涤包涵体


7. 用下述两种方法之一纯化和洗涤包涵体。


方法 1: 用 Triton X-100 提取包涵体


下述流程是对 Marston 等(1984) 所用方法的改进。


a. 细胞裂解物 4°C 高速离心 15 min。


b. 倾倒去除上清,沉淀重悬于 9 倍体积的 4°C 细胞裂解缓冲液Ⅱ。


c. 悬液室温放置 5 min。


d. 高速离心 15 min。


e. 倾倒上清,留置待用。沉淀重悬于 100ul 水。


f. 各取 10ul 上清和沉淀,分别与 10ul 2XSDS 凝胶加样缓冲液混和,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析靶蛋白的分布。


g. 必要时继续步骤 8 溶解包涵体。


方法 2: 用尿素提取包涵体


下面的程序是用含有不同浓度尿素的缓冲液洗涤和溶解包涵体,摘自 Schoner 等 (1985)。


a. 细胞裂解物 4°C 高速离心 15 min。

注意:步骤 b、d 和 f 必须在 4°C 进行。


b. 倾倒去除上清,每克(湿重)菌体沉淀重悬于 1 ml 水中。每支 100ul 装 4 支离心管,其余 4°C 保存。


c.4°C 高速离心 15 min。


d. 毎份沉淀重悬于 100ul 含不同浓度(如 0.5、1、2 和 5mol/L) 尿素的 0.1mol/L Tris-Cl(pH8.5)。


e.4°C 高速离心 15 min。


f. 倾倒上清,留置待用,每份菌体沉淀重悬于 100ul 水中。


g,各取 10ul 上清和沉淀,分别与 10ul 2XSDS 凝胶加样缓冲液混和,SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分析哪个浓度的尿素洗涤效果最佳。


h. 用步骤 g 确定的最佳浓度,按上述方案洗涤剩余包涵体沉淀(步骤 b)。


i. 必要时继续步骤 8 溶解包涵体。


溶解包涵体


8. 取适量步骤 7 的重悬细胞沉淀,4°C 高速离心 15 min, 沉淀重悬于 100ul 含 0.1 mmol/LPMSF(现用现加)的包涵体溶解缓冲液 I。


9. 室温放置 lh。


10. 把溶液加入到 9 倍体积的包涵体溶解缓冲液 II 中,室温放置 30 min。检査 pH 是否维持在 10.7, 必要时用 10mol/LKOH 调节。


11. 用 12mol/L 盐酸将溶液 pH 调至 8.0, 室温放置至少 30 min。


12. 室温高速离心 15 min。


13. 倾倒上清,留置待用,沉淀重悬于 100ul 1XSDS 凝胶加样缓冲液。


14. 取 10ul 上清与 10ul 2xSDS 凝胶加样缓冲液混和,上清和沉淀分别进行 SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳,分析溶解程度,继续附加方案。


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