Cell：系统解析我国H7N9流感病毒流行和进化特点
7月19日，以南京农业大学为第一完成单位联合扬州大学和中国科学院微生物研究所等单位，在微生物领域顶级期刊《Trends in Microbiology》上发表论文“Epidemiology, Evolution and Pathogenesis of H7N9 influenza viruses in five epidemic waves since 2013 in China”。
《Trends in Microbiology》是CELL系列子刊，创刊于1993年，该期刊2016年影响因子为11.02，近5年平均影响因子为10.239。南京农业大学动物医学院粟硕教授为论文第一作者，扬州大学兽医学院顾敏副研究员为论文共同第一作者，中国科学院微生物研究所的刘翟研究员和高福院士以及中国科学院武汉病毒所的崔杰研究员等为论文的主要作者。扬州大学兽医学院刘秀梵院士和南京农业大学周继勇教授为论文通讯作者。
自2013年3月中国发现了首例人感染H7N9禽流感病毒病例以来，每年冬春季都会出现一波人感染的疫情，截止到2017年7月止已有五波疫情超过1500人感染H7N9流感病毒。从2017年初开始，我国广东省和台湾省发现部分H7N9病毒在HA蛋白裂解位点插入4个氨基酸（KRTA），可能会导致这些病毒由原来对鸡不致病转变为高致病性，同时出现了高致病性H7N9流感病毒感染人的病例，随后在湖南、河北等省的部分家禽养殖场也开始爆发新发的高致病性H7N9禽流感病毒疫情，超过30万羽鸡被扑杀。H7N9流感病毒不仅对人类健康造成巨大威胁，也严重威胁我国的养殖业。因此，新出现的高致病性H7N9禽流感疫情受到全社会的高度关注。
由南京农业大学动物医学院周继勇教授团队牵头，多个单位的科研人员对2013年以来的五波H7N9流感病毒疫情从病例临床特征、分布范围、病毒的进化趋势和生物学特征等方面进行了系统流行病学研究和分析。疫情特征表现为，珠三角与长三角地区病例数显著高于其他地区，男性病人显著高于女性病例。
针对H7N9流感病毒目前在我国的流行特点和基因组序列进化特征，研究人员首次对造成5波疫情的H7N9流感病毒进行大数据遗传进化分析，通过进化分析发现，第四波H7N9流感病毒由第三波病毒进化而来，并且主要分布于珠三角区域，而第五波病毒由第四波进化树而来，且第五波中的高致病性毒株均来自于珠三角区域并形成一个独立的分支，提示高致病性H7N9流感病毒可能起源于珠三角地区。 此外，通过对病毒基因组序列的氨基酸位点分析，研究人员发现新出现的H7N9流感病毒HA蛋白获得了高致病性禽流感病毒裂解位点的特征，NA蛋白出现了R292K、E119V、 R152K , I222K/R的突变，揭示了潜在的多重耐药特征，提示未来需加强临床上的耐药监测，以便及时调整治疗方案。同时论文还首次系统总结和分析了H7N9病毒的受体结合位点的改变以及其潜在的影响。
高致病性H7N9禽流感病毒的出现，不仅威胁人类健康，也给我国的养禽业带来巨大的经济损失，应持续加强对该病毒的监测。该论文首次通过对五波H7N9疫情中分离的H7N9病毒进行系统遗传进化分析揭示H7N9病毒在我国的遗传演化特征和流行特征，为防控新发的高致病性H7N9流感病毒感染人和高致病性H7N9在禽中的爆发提供重要指导和理论依据。
