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RT-PCR PROTOCOL

2019.7.25

RT-PCR PROTOCOL


材料与方法…………………………………………………………

    1.材料 ………………………………………………………

1.1 供试用组织(细胞)…………………………………

1.2 主要仪器设备………………………………………

1.3 主要试剂……………………………………………

1.4 工具酶及试剂盒……………………………………

    2.实验方法……………………………………………………

2.1     总RNA提取…………………………………………

2.2 RT-PCR………………………………………………

2.3     琼脂糖凝胶电泳……………………………………


材料与方法

1.    材料

1.1    供试用动物组织/细胞


1.2    主要仪器设备

1.5ml离心管、0.2ml PCR管、高速离心机、5~10ul加样器、2~20ul加样器、20~200ul加样器、TAKARA  PCR仪、551可见光透射仪


1.3    主要试剂

RNAlocker、RNAout、RNAsaver、氯仿、异丙醇、75%乙醇、琼脂糖、SYBRGREEN I染料。

1.4    工具酶及试剂盒

TaKaRa One Step RNA PCR Kit


2.    方法

2.1    RNA提取和纯化

估算RNAout、组织或细胞的用量。取组织或细胞后,将剩余的组织或细胞放入RNAlocker中保存以备下次使用。将组织或细胞匀浆后,加入1.5ml离心管。加入0.2倍RNAOUT体积的氯仿,振荡混匀30秒。室温离心15000g 3分钟。将上清液转移到另一干净离心管中。在上清液中加入等体积的异丙醇,振荡器上振荡混均30秒。室温离心15000g 5分钟,RNA沉淀将在离心底的侧面形成,小心吸弃上清液。清洗:在含RNA沉淀的离心管中加入1毫升75%乙醇,振荡器上振荡混均30秒。室温离心15000g,1分钟。小心吸弃上清液。重复清洗步骤。将离心管倒置于滤纸上以干燥RNA。加DEPC水使RNA沉淀溶解,剩余的RNA沉淀使用RNAsaver溶解以备下次使用。


2.2    RT-PCR

2.2.1    TaKaRa One Step RNA PCR Kit,按下列组成配制RT-PCR反应液。

10×One Step RNA PCR Buffer                   5μl

 MgCl2(25mM)                               10μl

dNTP Mixture(10mM)                        5μl

Rnase Inhibitor(40U/μl)                  1μl

AMV RTase XL(5U/μl)                      1μl

AMV-Optimized Taq(5U/ul)                  1μl

上游特异性引物(20μM)                       1μl

下游特异性引物(20μM)                       1μl

Positive Control RNA或实验样品(≤1μg total RNA)*         1μl

 Rnase Free dH2O                           24μl

        Total                          50μl/Sample

*当目的RNA的表达数量较少时,可加至25μl。同时在反应体系中相应地应叫少Rnase Free dH2O的量。

2.2.2    按以下条件进行RT-PCR反应。

50   30min        RT反应

94   2min         RTase失活

94   30sec

37~65℃   30sec

72   1~10min      PCR反应25~30循环

    RNAPositive Control RNA时,反应条件如下。

50       15min         RT反应

94       2min          RTase失活

94       30sec

60       30sec

72       1.5min         25~30循环

2.2.3  反应结束后,取PCR反应液 (5 ~ 10 l) 进行琼脂糖凝胶电泳,确认RT-PCR反应产物。

如果此PCR产物需用于以后实验,应将PCR产物冷冻保存。

Control反应时扩增片段大小为462 bp



2.3    RT-PCR产物确认


电泳后,将SYBRGREEN I染色的凝胶用可见光透射仪观察结果,确认RT-PCR产物。


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