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RT-PCR实验原理与步骤

2020.9.07

【实验原理】
RT-PCR 是以RNA 为模板经逆转录反应(Reverse Transcription,RT)产生cDNA 第一链,再以cDNA 为模板进行PCR 扩增以检测目的基因的表达情况。
【实验仪器】
1. 恒温金属浴
2. PCR 扩增仪
【试剂及配制】
RNA PCR Kit (AMV) Ver 3.0
试剂包括:
1. AMV 反转录酶XL (5 U/ul)
2. 10×反转录反应缓冲液
3. RNAase 抑制剂(40 U/ul)
4. 随机引物9 mers (50 pmol/ul)
5. RNAase Free dH2O
6. TaKaRa Ex TaqTM HS (5 U/ul)
7. 5×PCR 反应缓冲液
8. dNTP Mixture (各10 mM)
【实验步骤】
1. 反转录反应
1) 按下列组成配制反转录反应液
MgCl2 2ul

2. PCR 反应
1) 按下列组成配制PCR 反应液

2) 把此反应液加入到第一阶段反转录结束后的PCR 反应管中,轻轻混匀;
3) 按以下条件进行PCR 反应:94 ℃ 2 min,94℃ 30 sec、55 ℃ 30 sec、72℃ 4 min、30 cycles,72℃ 5 min。
4) 琼脂糖凝胶电泳检测结果。
【注意事项】
1. PCR 条件设定
退火温度可根据实际情况适当地提高或降低(50℃~60℃)。延伸时间因目的序列长度不同而不同。cDNA 量较少时,循环次数可增加为40~50 次。
2. 当同时需要进行数次反应时,应先配制各种试剂的混合液(MasterMix),然后再分装到每个反应管中。
3. 使用酶类时,应轻轻混匀,避免起泡;分取前要小心地离心搜集到反应管底部;由于酶保存液中含有50%的甘油,粘度高,分取时应慢慢吸取。
4. 酶制品应在实验前才从-20℃中取出,使用后也应立即放回-20℃中保存。
5. 分装试剂时务必使用新的Tip 头,防止样品间污染。
6. 最佳的PCR 条件,因PCR 扩增仪的不同而不同,所以在使用您的样品之前最好先试做一下Control 反应,以确定最佳的PCR 条件。

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