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生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功...(一)

2020.7.01

生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready 应用


生物标志物研究与早期药物研发基因表达分析功能学检测RealTime ready应用

 

Sabine Lohmann*, Andrea Herold*, Tobias Bergauer#, Anton Belousov+, Gisela Betzl *, Manuel Dietrich*, Manuela Poignée-Heger *, David Geho’, Martin Weisser+

*Roche Applied Science, Penzberg, 德国
+Roche Pharma, Penzberg, 德国
#Roche Pharma, Basel, 瑞士
 ’Roche Pharma, Nutley, 美国

 

前言

生物标志物与早期临床药物研发抗-TWEAK复合物研发举例
TWEAK(肿瘤坏死因子样细胞凋亡弱诱导因子)是一种多功能细胞因子,可控制包括细胞增殖、迁移、分化、凋亡、血管生成,以及炎症在内的多种细胞活动。TWEAK通过与Fn14结合发挥作用,Fn14  是一种具有高度诱导性的细胞表面受体,与包括细胞核因子- kB(NF-kB)途径在内的多种细胞内信号途径具有相关性(2)。


Anti-TWEAK (RO5458640) 是一种直接针对TWEAK的重组人化 IgG1κ单克隆抗体。RO5458640 可与 TWEAK 结合,从而阻断 TWEAK 与受体结合。Fn14:抑制TWEAK:Fn14 信号途径与相应下游作用可促进肿瘤生长 (3)。

TWEAK 可与细胞外受体 Fn14 结合,通过 NF-κB 途径,
TWEAK与 Fn14 的结合可诱导信号转导。


根据文献搜索与TWEAK信号转导途径生物学芯片数据,应用“关键词”搜索功能,于RealTime ready配置门户网完成一个RealTime ready NF-kB定制型多孔检测板的配置。为生成首个假设,使用RealTime ready NF-kB panel,于9种不同的肿瘤细胞系(经过处理细胞系对未处理细胞系,于不同时间点,共使用 54 份样本)中,进行体外基因表达分析。根据细胞系结果,使用简化 NF-kB panel(35种参数),确认体内小鼠移植模型中的潜在生物标志物。基于细胞系与移植物测定结果,鉴定出13种潜在性、候选基因。为对假设进行检验,从上述参数中筛选出 6 种参数,进行人FFPE样本分析。上述6种参数与所选参考基因适合于感兴趣的实体肿瘤(BC、CRC、NSCLC、肉瘤、RCC)。已经开发出RealTime ready qPCR检测,并已经进行FFPET RNA分离功能的优化。

个体化医疗(PHC)根据基因信息,针对个体的遗传独特性,对个体进行卫生保健、疾病预防与治疗服务,满足个体需要。对特定生物状态指示剂的生物标志物分子的识别与鉴定,在个体化医疗中具有重要作用(1)。因此,生物标志物是药物从靶点鉴定至药物应用生命周期的核心元素。前列腺素特异性抗原
(PSA)、c-反应蛋白(CRP),与HER2/neu仅是众多生物标志物分子中的少数几个。


生物标志物研究中,人们对复杂生物背景下mRNA表达研究抱有浓厚兴趣。RealTime ready RT-qPCR检测与RealTime ready 配置门户网站在线完成相关标志物基因的选择,qPCR功能检测有助于了解基因表达概况。LightCycler®480多孔板上RealTime ready 定制型检测多孔板上含有用户选择的、预置人、小鼠或大鼠靶序列qPCR检测(https://configurator.realtimeready.roche.com)。我们已经建立起细胞系(体外)、移植小鼠模型(体内),与各种人类研究样本FFPET切片生物标志物研究的基因表达分析工作流。


生物标志物研究RealTime ready qPCR检测。可满足不同检测质量要求。生物标志物在治疗性药物复合物研发周期全程均非常重要(TWEAK复合物研发仅是一个例子。LightCycler® 480 real-time PCR 平台联合使用。

 


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