LincRNA-EPS如何通过转录制动来发挥抑制炎症作用
麻省大学医学院的Katherine研究团队于6月16号在Cell上发表了lincRNA-EPS能够抑制免疫炎症反应的研究成果，进一步证明lincRNA在免疫系统中的重要性。
研究背景
基因间长链非编码RNA （Long intergenic noncoding RNAs, LincRNAs）是基因表达的重要调节者，虽然lincRNAs在免疫细胞中表达，但是他们在免疫上的功能并未得到广泛的研究。而先天免疫系统作为抗菌感染的防御第一线，依赖着动态的转录调节改变，在模式识别受体 (germline-encoded pattern-recognition receptors) ，如Toll-like受体（TLRs），检测到微生物入侵时会发挥其应有的作用。炎症基因的表达在抗菌防御方面来说显得极其关键，而信号依赖的转录因子的激活，转录共调节因子，染色质修饰因子协同控制抗菌防御的炎症反应。
研究目的
探究lincRNA-EPS在细胞中对免疫反应的作用
思路与方法
研究结果
1. 巨噬细胞中的lincRNA-EPS水平随着对微生物与炎症触发物的应答而动态调节，在暴露于微生物配体的巨噬细胞中lincRNA-EPS受到抑制。
2. lincRNA-EPS导致IRGs的时序调控特殊方式，且其基因删除增强了巨噬细胞中IRGs的表达，经实验验证lincRNA-EPS的异位表达阻止巨噬细胞中IRGs表达，即lincRNA-EPS在巨噬细胞中扮演着炎症反应抑制者的角色。
图1 基因删除增强了巨噬细胞中IRGs的表达
3.lincRNA-EPS在休眠的巨噬细胞中与核染色质相关联，实验证明lincRNA-EPS在转录水平上调控IRGs的表达，并调控核小体定位。
图2 lincRNA-EPS在休眠的巨噬细胞中与核染色质相关联
图3 lincRNA-EPS在转录水平上调控IRGs的表达，并调控核小体定位。
4.hnRNPL是lincRNA-EPS的结合蛋白，其结合序列为位于30-531区域的CANACA基序，该结合基序是抑制IRGs与结合hnRNPL蛋白的关键。
5.由于lincRNA-EPS缺陷细胞在基础条件与TLR4刺激条件下都表现出IRGs表达增加，故他们假设lincRNA-EPS抑制体内炎症并通过实验得到证实。
图4 lincRNA-EPS抑制体内发炎
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