关注公众号

关注公众号

手机扫码查看

手机查看

喜欢作者

打赏方式

微信支付微信支付
支付宝支付支付宝支付
×

Northern Blot实验仪器试剂和方法步骤(1)

2020.9.07

[仪器、试剂、材料]
(一)仪器
恒温水浴箱,电泳仪,凝胶成像系统,真空转移仪,真空泵,UV 交联仪,杂交炉,恒温摇床,脱色摇床,漩涡振荡器,分光光度计,微量移液器,电炉(或微波炉),离心管,烧杯,量筒,三角瓶,等。

(二)材料
总RNA样品或mRNA样品,探针模板DNA(25 ng),尼龙膜
(三)试剂
NorthernMax Kit(Cat.# 1940,Ambion, Inc.),琼脂糖,DEPC, X光底片,底片暗盒,Random Primer, dNTP Mixture,111 TBq/mmol[a-32P]dCTP,Exo-free Klenow Fragment和10 X Buffer, Sephadex G-50,SDS,双氧水, 灭菌水等。

[方法与步骤]
1.用具的准备:
180度烤器皿:三角锥瓶、量筒、镊子、刀片等4小时。
电泳槽:清洗梳子和电泳槽,并用双氧水浸泡过夜,用DEPC水冲洗,干燥备用。
处理DEPC水(2 L)备用。

2.用RNAZaP去除用具表面的RNase酶污染
用RNAZap擦洗梳子,电泳槽,刀片等,然后用DEPC水冲洗二次,去除RNAZap。

3.制胶:
1.称取0.36mg 琼脂糖加入三角锥瓶中,加入32.4mlDEPC水后,微波炉加热至琼脂糖完全熔解。60℃空气浴平衡溶液 (需加DEPC水补充蒸发的水分)
2.在通风厨中加入3.6ml的10*Denaturing Gel buffer,轻轻振荡混匀。
注意尽量避免产生气泡。
3.将熔胶倒入制胶板中,插上梳子
如果胶溶液上存在气泡,可以用热的玻璃棒或其它方法去除,或将气泡推到胶的边缘。注:胶的厚度不能超过0.5cm。
4.胶在室温下完全凝固后,将胶转移到电泳槽中,加入1x MOPS Gel Running buffer盖过胶面约1cm,小心拔出梳子。(配制250ml 1*MOPS Gel Running buffer,在电泳过程中补充蒸发的buffer。)
5.检查点样孔。

4.RNA样品的制备
在RNA样品中加入3倍体积的formaldehyde load dye和适当的EB(终浓度为10ug/ml)。混匀后,65℃空气浴15min。短暂低速离心后,立即放置于冰上5min。

5.电泳:
1.将RNA样品小心加到点样孔中。
2.在5V/cm下跑胶(5x14cm)。在电泳过程中,每隔30min短暂停止电泳,取出胶,混匀两极的电泳液后继续电泳。当胶中的溴纷蓝(500bp)接近胶的边缘时终止电泳。
3.紫外灯下,检验电泳情况,并用尺子测量18S、28S、溴纷蓝到点样孔的距离。
注意不要让胶在紫外灯下曝光太长时间。

6.转膜
1.用3%双氧水浸泡真空转移仪后,用DEPC水冲洗。
2.用RNAZap擦洗多孔渗水屏和塑胶屏,用DEPC水冲洗二次。
3.连接真空泵和真空转移仪,剪取一块适当大小的膜(膜的四边缘应大于塑胶屏孔口的5mm),膜在Transfer buffer浸湿5分钟后,放置在多孔渗水屏的适当位置。
4.盖上塑胶屏,盖上外框,扣上锁。
5.将胶的多余部分切除,切后的胶四边缘要能盖过塑胶屏孔,并至少盖过边缘约2mm,以防止漏气。
6.将胶小心放置在膜的上面,膜与胶之间不能有气泡。
7.打开真空泵,使压强维持在50~58mbar;立即将transfer buffer加到胶面和四周。每隔10min在胶面加上1ml transfer buffer,真空转移2小时。
8.转膜后,用镊子夹住膜,于1x MOPS Gel Running buffer中轻轻泡洗10秒,去除残余的胶和盐。
9.用吸水纸吸取膜上多余的液体后,将膜置于UV交联仪中自动交联。
10.将胶和紫外交联后的膜,在紫外灯下检测转移效率。(避免太长的紫外曝光时间)
12.将膜在-20℃保存。

推荐
关闭