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浅谈临床微生物检测

2021.5.15

随着现代信息技术和医学生物学,特别是医学分子生物学的发展,医学微生物学检验技术近年来获得了长足的进步,并逐渐成为指导临床感染诊断和治疗的重要依据。然而,目前我国的医学微生物学检验事业远未达到令人满意的程度,还有许多问题需要我们去思考、研究和解决。

本期嘉宾:徐州医学院附属医院    检验科副主任   顾兵

《医学仪器与试剂》(一下简称“《医》”):您的实验室在质谱技术的应用上有哪些项目,能不能给我们用实例谈一下质谱检测的优势、特点等?

顾兵:

1975年,Anhalt和Fenselau两位学者首次提出将该技术用于细菌鉴定。上世纪80年代,研究人员不断完善质谱检测技术;直至上世纪90年代末,基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desorption/ Ionization Time of Flight Mass Spectrometry, MALDI-TOF MS)开始成功用于细菌及真菌的鉴定。

    近年来,质谱技术相继通过美国FDA和中国CFDA的认证,MALDI-TOF质谱检测技术在临床微生物检验领域有着广阔的应用前景。质谱技术在鉴定微生物的最主要优势是可到达快速病原菌鉴定的目的,相对于传统微生物培养方法,质谱仪可以在数分钟内报告鉴定结果。目前本实验室在质谱技术上的应用有两个方面:(1)临床罕见细菌的鉴定:包括常规培养、生化反应不能准确鉴定出的细菌;特殊标本中检出的特殊病原菌;(2)科研方面:包括耐药菌株蛋白组学;联合分子生物学方法对耐药菌株的耐药机制研究。

对于微生物病原体鉴定这一感染诊断的关键环节,MALDI-TOF质谱鉴定将会逐步取代传统的生化方法,成为微生物鉴定的主流方法和标准。同时,也将推动和提速微生物实验室的全面自动化与工作流程优化,真正改变微生物实验室的面貌,对感染疾病诊疗和抗生素合理使用与管理提供更加有力的支持。质谱技术是临床微生物领域的革命性技术,希望各临床微生物工作人员要注意加强学习,了解这一最新动态。

《医》:微生物快速培养检测对小儿肺炎支原体感染诊断的价值及经验?

顾兵:

微生物培养与鉴定一直是诊断微生物相关感染的金标准,小儿肺炎常见的是支原体肺炎,因此微生物快速培养检测对小儿肺炎支原体感染诊断十分必要,相比于快速血清检测的方法,在检测阳性率、以及诊断准确定性方面具有重要的价值,并且可以弥补快速血清检测方法在较小年龄肺炎支原体感染患儿(1岁以下)阳性率低的不足。必要时,可以联合应用。

《医》:MIC测定及临床应用评价?

顾兵:

MIC的测定可以非常直观的反映细菌对不同抗菌药物的耐药水平,相对于K-B法,在指导临床用药剂量方面更有价值,无论是对于剂量依懒性药物还是时间依懒性药物,都可根据MIC值进行调控。另外,分离自不同个体间的菌株对不同抗菌药物敏感性不同,可充分体现个体化用药的原则。

《医》:临床细菌学检验在质量控制上存在盲区,以您的经验,能不能谈一谈您觉得最应该注意的一些点?

顾兵:

虽然我们非常注重病原菌鉴定及药敏的质控,但是,依然存在一些相对的“盲区”。比如:标本的采集与送检。这涉及科室多、人员多、人员层次不一,是微生物正确检验的前提,也是微生物检验质量控制难点。目前,微生物培养的痰标本约有50%是不合格标本。因此,如何与临床医生及患者沟通,如何制作详细的通俗易懂的标本采集说明,提升标本质量,是检验人应该努力的方向。目前,智能手机和互联网的普及,我们可以考虑制作简短的视频,让患者一目了然,知道如何留取高质量的标本。

    影响标本的质量还有一个被大家所忽视的因素就是标本采样工具和转运系统。包括容器、运输介质、采样工具、包装和运输环境等。在过去的几十年里,国际上临床微生物标本转运介质及工具发展迅速,国际上一些知名医院开始逐步采用新型标本采集拭子与转运系统,如笔者2012年访问学习的美国加州大学洛杉矶分校(University of California Los Angeles, UCLA)正在切换使用新型的标本采集拭子与转运系统,以提高临床微生物检验质量。然而由于新型临床微生物标本采集拭子及转运系统成本较高,以及国内临床微生物检验收费普遍较低等因素,国内绝大数医院的临床微生物实验室还没有开始使用新型标本采集拭子及转运系统。近年来,微生物检验的标准化和自动化已成为各个实验室的发展方向。自动化的检验能够提高检验质量,提高检验效率,减少人为误差,并能够节省人力,提高生物安全性等。采用方便、快捷、高性能的标本转运系统在自动化的进程有重要意义。

《医》:您对微生物技术的发展趋势是如何看的?

顾兵:

从临床的需求角度来看,临床微生物检验最大的问题就是报告发放的速度太慢,培养及药敏短则需要3天,长则需要数周,难以满足临床的需求。所以与传统微生物检测方法相比,临床微生物检验技术的发展未来趋势主要是向“快”和“精准”两个方面发展。

“快”,故名思义,就是以最快的速度来进行细菌的鉴定和药敏。目前,采用质谱技术已经可以达到快速鉴定病原菌的目的,但尚不能解决快速药敏的检测。因此,未来质谱技术的一个重要的发展方向就是用于临床药敏的快速检测。

“精准”也很容易理解,就是说病原菌的培养、鉴定和药敏,仅仅有速度是不够的,还必须准确。这就需要我们不断加强学习、正确地采用各种临床微生物检验技术,做好质量控制,从而方能得到精准的报告。


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