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如何使用NMR对生物样本研究?

2020.2.12

高分辨率 NMR 已快速发展成为体液和组织分析中的主要工具。它可用于高通量且一键式全自动化地生成谱图数据,从这些数据中可自动定量生物标志物的含量,或与健康或疾病状态的统计模型相比较。由于其卓越的重现性和在不同实验室间的可转移性,它还可用于大规模流行病学研究。这些优点,加上标准操作流程和标准化工具平台,可将世界各地生成的数据与来自生物样本库网络的数据整合在一起。

NMR 与生物样本库及其日常工作的关系怎样?

NMR 可用于样本纳入生物样本库时的质量控制,同步产生的测量数据还可作为额外产生的分析数据而增加样本存储的附加价值:

  • „ 验证样本的类型,例如判定EDTA(乙二胺四乙酸)血浆、枸橼酸盐血浆,以及质量控制、检查污染和杂质

  • „ 生成每个样本的 NMR 谱图,用于输入生物样本库信息,其中NMR 谱图在标准条件下生成,可用于世界范围内不同生物样本库的整合波谱库

  • „ 同步生成包含114个参数的血清/血浆的脂蛋白亚分析数据

  • „ 增加一系列尿液定量数据,包括每个代谢物的参考浓度范围

NMR 用于波谱数据库应用和数据交换的适合性

同样 SOP 下、使用标准化 NMR 平台的 NMR 分析的重现性和可转移性见图 3。血清样本的等分样已经过制备和检测,使用同一仪器单独制备和检测的 15次重复测定之谱图叠图显示在上部,而下部叠图显示的是在同样 SOP 下、使用同一型号仪器在两个实验室分别采集的8个谱图数据的叠图。可以看出来,所有谱图都完美重叠。这证明来自不同生物样本库的谱图数据可用于综合统计分析。因此,对于新的研究,可使用谱图数据来代替取自生物样本库的新等分样。

使用分析数据给生物样本库增加价值

无论是哪个生物样本库,与样本有关的元数据都很重要。这些数据可以是患者数据、生活方式信息,也可以是分析数据,例如血浆/血清中的脂蛋白(包括亚类)浓度,尿液中内源性代谢产物的浓度等。通过直接使用质控时获得的谱图,可自动生成分析结果,包括从所有生物样本库测试样品所得到的各代谢物浓度的参考范围。
 


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