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质粒DNA的小量快速提取

2019.4.18

实验概要

本实验介绍了质粒DNA小量快速提取的基本原理及操作步骤。

实验原理

在碱性条件下,染色体DNA和质粒DNA都发生变性,但质粒DNA的超螺旋共价闭合环状结构的两条互补链不会完全分离,当用酸性的高盐缓冲液将pH中和至中性时,变性的质粒DNA又恢复到原来的构型并溶解在溶液中,而染色体DNA不能复性而形成缠连的网状结构。通过离心,缠结的染色体DNA与不稳定的大分子RNA、蛋白质—SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。上清液中的质粒DNA因不溶于70%的乙醇,可在加入乙醇后通过离心得到质粒DNA沉淀。

主要试剂

1. LB培养基

蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl10g加重蒸水950ml,待完全溶解后,用1N NaOH调pH至7.0,补加重蒸水至总体积1000ml,151bf/in2高压蒸气灭菌20分钟。

2. 氨苄青霉素:100mg/ml

3. 溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖;25mmol/L Tris—HCl(pH8.0);10mmol/L EDAT(pH8.0)

4. 溶液Ⅱ(临用时配):0.2mol/L NaOH,1%SDS

5. 溶液Ⅲ:0.5mol/L乙酸钾60ml;冰乙酸11.5ml;H2O28.5ml

6. 酚-氯仿:将酚和氯仿等体积混合后用0.1mol/L Tris-HCl (pH7.6)抽提几次以平衡这一混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆盖0.01mol/L Tris-HCl (pH7.6)液层,4℃保存。

7. 氯仿-异戊醇:将氯仿和异戊醇按24:1的比例混合。

8. TE缓冲液(pH8.0):10mol/L Tris-HCl(pH8.0);1mmol/L EDAT

9.  RNase 1mg/ml:称10mg RNase于Eppendorf管中,溶于1ml 10mmol/L  Tris-HCl(pH7.5)、15mmol/L NaCl溶液中,于100℃加热15分钟,缓慢冷却至室温,此液为10mg/ml  RNase浓度,应用时稀释至1mg/ml。

10. 70%乙醇、无水乙醇

主要设备

1. 37℃摇床

2. 1.5ml Eppendorf管

3. 微量台式高速离心机

4. 制冰机

5. -20℃冰箱

实验材料

大肠杆菌XL1-blue

实验步骤

1. 将含有pBS-SK质粒的大肠杆菌XL1-blue 10μl接种到10ml含氨苄青霉素(100μg /ml)的LB培养液中,37℃振摇过液。

2. 取1.5ml菌液转入Eppendorf管中,5000rpm离心1分钟,吸净上清。

3. 将细菌沉淀重悬于100μl用冰预冷的溶液Ⅰ中,剧烈振荡。

4. 加200μl新配制的溶液Ⅱ,盖紧管口,轻缓颠倒Eppendorf管5次,以混合内容物,禁止剧烈振荡。置冰浴中放置5分钟。

5. 加150μl用冰预冷的溶液Ⅲ,盖紧管口,反复颠倒数次,使溶液Ⅲ在粘稠的细菌裂解物中分散均匀,随后置冰浴中5分钟。

6. 用微量台式高速离心机12000rpm 离心5分钟,将上清转入另一Eppendorf管中。

7. 加等体积酚-氯仿,剧烈振荡1分钟后,12000rpm离心5分钟,将上层液转入另一Eppendorf管中。

8. 加等体积氯仿-异戊醇,剧烈振荡10秒钟后,短暂离心12000rpm1分钟,将上层液转入另一Eppendorf管中。

9. 室温下加2倍体积的无水乙醇,振荡混合,室温下静置5分钟。

10. 12000rpm离心5分钟,去上清液,加1ml 70%乙醇,短暂振摇,然后再离心(12000rpm分钟)。

11. 除去所有上清液,待待残余乙醇挥发干净后,加30μlTE缓冲液(pH8.0)溶解沉淀,加1μl RNase (1mg/ml),37℃保温15分钟,取出后即可用于酶切分析或置-20℃保存备用。


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