单细胞测序为免疫学带来数据驱动型革新
免疫系统由大量在宿主免疫系统发挥独特作用的特定细胞类型组成。在适应性免疫系统中，T和B淋巴细胞（T和B细胞）表达特定表面受体（T细胞受体[TCR]
和B细胞受体[BCR]），通过主要组织相容性复合体（MHC）识别并结合在抗原呈递细胞表面存在的特定抗原。通常，基于特定的表面分子标记，通过FACS分离各个免疫细胞类型。但是由于FACS
的技术限制，FACS分离的细胞可能仍由处在不同发育或激活阶段的混合群体组成，且FACS方法受可用的标记所限。与之相反，单细胞测序法不受特定分子标记的限制，并且可识别T细胞和B细胞中特定基因表达模式和剪接变异。
“计算机科学和单细胞测序技术的进步为免疫学带来了数据驱动型革新。” ——Neu等，2017年 B 细胞抗体库 抗体由B细胞在贯穿机体整个生命过程的一系列以发育顺序进行的体细胞基因重排中产生。抗体由二硫键连接的重链（VH）和轻链（VL）构成，决定了抗原结合的特异性。每个B细胞包含独特的由多个不同基因位点编码的VH
和VL 对。要正确预测抗体–抗原结合的特异性，应从同一单个B细胞分析VH和VL基因。 T 细胞抗体库 每个T细胞表达独特的TCR，TCR为由α和β链的独特组合构成的异二聚体蛋白质。TCR与抗原呈递细胞表面的MHC呈递的多肽抗原结合。多种单细胞测序法可用于TCR测序，而无需通过细胞裂解破坏α和β链配对。
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