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CASMS分论坛:蛋白质修饰与治疗中的质谱应用

2021.8.12

  分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在9日分论坛“Protein PTMs and Diseases”中,来自台湾中央研究院化学研究所Yu-Ju Chen博士、美国芝加哥大学Ben May 癌症研究所Yingming Zhao博士、瑞士联邦理工学院健康科学与技术部转化医学研究所Bernd Wollscheid博士、国家蛋白质科学中心Jing Yang博士、明尼苏达大学双城分校Yue Chen博士、普渡大学W. Andy Tao博士、等带来精彩的学术报告。分析测试百科网作为大会支持媒体,为您带来全程跟踪报道。

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台湾中央研究院化学研究所 Yu-Ju Chen博士

报告题目:Pushing Proteomics Sensitivity towards Proteomics-guide Precision Oncology

  Yu-Ju Chen博士表示,当不满足临床需要时,需要采用精准医疗。该团队通过确定年龄、性别相关的内源性和环境致癌突变过程,蛋白质组信息分类来区分早期临床特征,研究了东亚地区的非吸烟肺癌的蛋白质基因组学,制成了第一个非吸烟肺腺癌的深层蛋白质基因组图谱,从而可以使用蛋白质网络识别肿瘤发生,为生物标志物和药物靶点的利用提供前提。

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美国芝加哥大学Ben May癌症研究所 Yingming Zhao博士

报告题目:Lactate-stimulated Histone Lysine Lactylation: Chemistry, Proteome and Biochemistry

  Yingming Zhao博士表示,乳酸刺激的赖氨酸-乳酸酰化途径还没有确定。该团队通过模仿乙酸刺激赖氨酸乙酰化途径,检测到新的质量偏移,确定了PTM候选人,并且计算反应化学式,推断候选化学结构,从而确认新的PTM,为以后生物化学和生理学等做好铺垫。

  最后,Zhao博士也提出了一些问题。比如,酰基辅酶的产生及调控、酰基辅酶的分类、调节酶的特异性及遗传机制以及未来在生理学疾病方向的影响等。

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瑞士联邦理工学院健康科学与技术部转化医学研究所、瑞士生物信息学研究所 Bernd Wollscheid博士

报告题目:Light-mediated Discovery of Surfaceome Nanoscale Organization and Intercellular Receptor Interaction Networks

  Bernd Wollscheid博士介绍了一种可以对细胞表面蛋白进行系统规模量化的动态分析技术。他表示,空间蛋白质组学是一个先进的学科,细胞表面的高分率分析仍具有很大的研究潜力。因为目前只有不到20%的细胞表面蛋白质可以表达,剩下的80%仍然未经探索!

  LUX-MS是一种光蛋白质组学技术,能够对动态表面组的相互作用进行系统级分析。其揭示了抗体靶点及其急性表面组邻域,可以围绕SOG偶联抗原建立同步免疫突触,从而构建细胞间信号网络。并且,其利用表面膜组织数据选择性杀死癌细胞,实现了治疗模式下游应用的即插即用。该方法实现了对急性和动态表面时间相互作用的系统规模分析,具有全系统范围、灯光可控、配体类型随意、活细胞可用、可跨生物体、免遗传操作等优点。

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国家蛋白质科学中心 Jing Yang博士

报告题目:Mapping and Quantifying  -The Cysteine Redoxome

  Jing Yang博士表示,化学蛋白质组学为半胱氨酸的氧化还原网络提供了有利的条件。该团队研究了半胱氨酸介导的氧化还原变化对生理学和病理学中的蛋白质功能和氧化还原信号的影响,检测和分析了半胱氨酸氧化和氧化还原转化。

  总之,该报告展现了三种半胱氨酸氧化还原形式的整体分析的化学蛋白质组学方法,表明化学蛋白质组学为研究半胱氨酸介导的氧化还原网络提供了极好的机会。

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明尼苏达大学双城分校 Yue Chen博士

报告题目:Hypoxia-mediated Ubiquitination Signaling in Protein Homeostasis and DNA Damage Response

  Yue Chen博士表示,缺氧介导的泛素化会对蛋白质组学分析和DNA损伤反应造成影响。泛素化的生化特征有:泛素和底物的突变、亲和下拉和蛋白质印迹检测和体外泛素化活性测定。课题组通过研究泛素化的蛋白质组学分析,证明缺氧反应给蛋白质组的定量蛋白质组学分析带来了挑战。

  另一方面,缺氧条件下复制抑制刺激PCNA-Mono-Ub,触发了易位DNA合成(TLS),改变了DNA损伤反应中的泛素连接,拓宽了DNA损伤诱导的Ub信号的动力学,激活DNA损伤反应中的Ub信号。

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普渡大学 W. Andy Tao博士

报告题目:Profiling Protein PTMs in Circulating Extracellular Vesicles

  W. Andy Tao博士介绍了蛋白质翻译后修饰(PTM)的谱学分析。由于细胞外小泡(EV)含有较大尺寸的微泡和纳米尺寸的外质体,组成性地从所有类型的细胞中脱落到血液中,在癌症、自身免疫疾病和心血管疾病中调解局部和全身沟通,因此被选为蛋白质修饰的基体。

  该课题组通过确定蛋白质的活性状态、定位、稳定性和周转率,利用分子相互作用的调节、蜂窝内和蜂窝间信号、基因表达的调节来进行蛋白质组学研究。生物流体中PTM蛋白检测十分复杂。作为生物标志物,许多EV磷蛋白具有癌症特异性。研究中使用EVTRAP分离EV蛋白和磷酸化蛋白,减少了经济消耗。同时,利用EVTRAF捕获外小体,从尿液中捕获EV,完成了仪器上EV隔离的工作流程。另外,还研究了临床参数的相关性,建立了疾病生物标志物的人工智能模型。

  关于Protein PTMs and Diseases分论坛的演讲人介绍,请见:http://www.casms.org/?action=content&id=44

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