注重实践经验!Urimarker 2020线上-会前培训率先登场

2020年5月15日 15:30:01 来源: 分析测试百科
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  分析测试百科网讯 2020年5月15日-17日,第二届尿液生物标志物网络研讨会(Urimarker 2020)线上直播召开。Urimarker 2020由北京师范大学与分析测试百科网联合主办,基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、中国医学科学院基础医学研究所协办,北京师范大学生命科学学院承办。

  会议邀请对临床生物标志物研究有兴趣的临床医师、检验科医生、科研院所和高校研究人员,蛋白质组/代谢组 /microRNA 等组学分析领域的专家,生物样本库专家,临床大数据专家,科学出版领域和风险投资领域的专家,共同讨论尿液生物标志物研究的进展和临床应用前景,促进各个领域专家的合作,建立一个平等、自由、高效的学术交流与合作的平台,展示各领域的研究成果、研究能力和合作意愿,探索新的契机,推进尿液生物标志物研究各领域深入发展和成果的临床转化

  15日率先召开Urimarker 2020会前技术培训,针对尿液相关研究和应用中所涉及到的问题,相关团队介绍了其研究经验,包括样品尿液收集、贮存、质谱分析、数据分析等。

  青岛市市立医院秦伟伟带来题为《尿液样品收集和贮存》的精彩报告。

  报告首先介绍了利用膜(硝酸纤维素膜/尼龙膜)吸附尿液中生物成分(蛋白质/RNA),干燥后存储在真空袋中。该方法实现了尿液的室温保存,解决了尿液样本贮存和运输的问题。

  对于从婴幼儿采集尿液困难的问题,报告介绍了一种利用纸尿片收集尿蛋白的方法。用绒毛尿作为吸收体收集尿液,将尿蛋白洗脱并吸附在膜上,将蛋白结合膜干燥后存放在真空袋中,可室温保存。

  为实现在居家环境中对尿液的收集和保存,报告介绍了一种滤器联合注射器的家用套装:包含一个可换膜滤器和一个注射器等。注射器提供压力,使尿液依次通过滤器中的隔离膜和吸附膜,将蛋白结合膜干燥并保存在真空袋中,可室温保存7-10天。

  报告还介绍了一种干燥法的保存泪液的方式:Schirmers试纸条收集泪液,干燥后储存在真空袋中,可室温保存2周。

  中国医学科学院基础医学研究所汤晓悦带来题为《尿液样本制备》的报告。

  完整的尿液蛋白质组学分析流程包括样本的收集与保存,尿液样本的前处理,液质分析和数据处理几个环节。

  报告共介绍了7种尿液样本的前处理方法: In-solution、FASP、96 FASP/q96 FASP、Mstern Blotting、Strap、iST、C4 tip。分别对每种方法的工作流程,处理时间,通量,方法优缺点及相应的应用分析进行了介绍。最后报告对In-solution、S-trap、iST和Mstern Blotting4种方法进行了比较分析。

  中国医学科学院基础医学研究所郭正光带来题为《质谱采集方法和优化》的报告。

  质谱仪是高通量蛋白质组分析的有力工具。报告介绍了蛋白质组学各种定量分析策略。首先介绍了发现蛋白质组学的定量技术,如TMT/iTRAQ技术、Label-free,DIA等。

  标记定量技术的优点有方法简单、易操作;蛋白通量高,覆盖度高;MS2定量,准确性好;样本混合上样,平行性好;实验室内、实验室间重现性好。缺点有每次分析个数有限;标记试剂成本高;信号压缩等。

  Label-free技术的优点包括无需标记,操作简单,成本低;通量高;无样本数限制。然而Label-free技术需要保证很好的色谱重现性。

  最新的数据非依赖采集DIA技术,该技术结合DDA和SRM技术的优点,不丢失任何信息,数据可回溯。接下来报告介绍了靶向蛋白质组学的定量技术,包括PRM和MRM技术的原理和主要的技术策略。

  报告还简介了各种定量蛋白质组学的方法在尿液蛋白质组学研究中的应用案例。

  上海易算生物科技有限公司沈诚频带来题为《基于iomicsCloud的在线分析流程》的精彩报告。

  Omics Cloud平台整合了组学数据分析中所有常用的统计分析工具以及高级功能分析工具,如.主成分分析(PCA) 、 偏最小二乘法判别分析(PLS-DA) 、 基于正交信号校正的偏最小二乘判别分析(OPLS-DA) 、 层聚类分析(HCA) 、 MFUZZ分析、 假设检验、 P值校正、 STRING蛋白互作网路图绘制、 GO和KEGG富集分析等,真正做到蛋白组和代谢组的 ”一站式” 数据分析。

  Omics Cloud的所有工具中都预设了推荐的统计/功能分析参数,用户可以使用默认的参数进行分析,快速查看数据质量等信息,也可逐一调节参数,进行自定义分析.而用户对参数所作的一切调整都会在右边的分析结果呈现界面实时展现,在某些分析中您甚至可以一边拖动参数条,一边查看图表的变化,找出最满意的参数。

  中国医学科学院基础医学研究所杨啸林带来题为《FAIR准则与生物医学数据建设标准》的精彩报告。

  报告介绍了数据库构建的FAIR准则、生物医学数据标准和生物医学本体应用。FAIR准则为可发现、可访问、可重用、可互操作这四项。生物医学数据标准涉及格式标准、最小信息标准、术语标准等。

  报告还介绍了生物医学本体及其应用,如:OBO Foundry及其本体资源、基因本体GO、GO注释、GO富集分析、人类表型本体、疾病与表型的本体及FAIRsharing、Ontoportal Alliance等相关数据平台。

Urimarker 2020直播预告

Urimarker 2020会议5月16日9时精彩继续,直播观看链接:https://live.polyv.cn/splash/1263786,填写预登记的手机号即可观看

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Urimarker 2020会议日程