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10年曹雪涛团队在Nature/Cell/Science等发表164篇文章

2023.3.27

  SMARCC1 (BAF155, SRG3)作为SWI/SNF复合物的核心成分之一,在激活晚期炎症基因以应对微生物挑战中发挥重要作用。然而,SMARCC1调控炎症先天反应的机制尚不清楚。

  2023年2月15日,中国医学科学院北京协和医学院曹雪涛及姜明红共同通讯在Cell Reports在线发表题为“RNF138 inhibits late inflammatory gene transcription through degradation of SMARCC1 of the SWI/SNF complex”的研究论文,通过功能筛选,该研究发现核E3泛素连接酶RNF138是炎症先天反应的负调控因子,并表明RNF138与SMARCC1相互作用,介导其K48连接的Lys643位点多泛素化和蛋白酶体降解。

  因此,RNF138的催化活性通过抑制SWI/SNF调控基因位点上的染色质重塑来微调晚期炎症基因转录的动力学。类风湿关节炎患者单核细胞RNF138降低,SMARCC1升高。这些结果为核小体重塑、炎症和泛素化之间的相互作用提供了机制上的见解,并强调了E3泛素连接酶在控制炎症反应的程度和持续时间方面的重要作用。

  另外,2023年1月18日,海军军医大学/中国医学科学院北京协和医学院/南开大学曹雪涛及海军军医大学刘娟共同通讯在Cell Reports 在线发表题为“Glycosyltransferase Extl1 promotes CCR7-mediated dendritic cell migration to restrain infection and autoimmunity”的研究论文,该研究表明糖基转移酶Extl1促进CCR7介导的树突状细胞迁移以抑制感染和自身免疫。该研究为CCR7触发的DC迁移在免疫和耐受性中的调控提供了机制见解,并为治疗感染性和自身免疫性疾病提供了潜在的靶点(点击阅读)。

  2023年1月5日,海军军医大学曹雪涛与刘娟在Cell Research杂志在线发表题为“RBP–RNA interactions in the control of autoimmunity and autoinflammation”的综述文章,这篇综述总结和讨论了RBP-RNA相互作用在控制异常自身免疫性炎症中的功能及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力(点击阅读)。

  最后,iNature编辑部结合Pubmed及Web of Science发现曹雪涛团队从2014年到2023年(截至2023年3月25日)在Nature (2篇),Science (4篇),Cell (3篇),Nature Immunology(8篇),Cancer Cell(5篇),Nature Reviews Immunology(2篇),Immunity(4篇),Cellular & Molecular Immunology(19篇),JOURNAL OF AUTOIMMUNITY (13篇),Cell Research (6篇),Cell Reports(6篇),PNAS(8篇),Nature Communications (9篇),Signal Transduction and Targeted Therapy(5篇),JOURNAL OF IMMUNOLOGY(5篇),Oncoimmunology(7篇),Hepatology(3篇),Protein Cell (3篇)及JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE (4篇)等发表164篇文章(仅包括综述及研究论文,通讯作者的有117篇文章)(文章后附列表),专注于免疫领域。另外,由于时间匆忙,如有错误,可向编辑部反馈。

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  炎症被认为是病原体相关分子模式(pathogen-associated molecular patterns, PAMPs)或损伤相关分子模式(damage-associated molecular patterns, DAMPs)诱导宿主免疫系统释放多种细胞因子和趋化因子的保护性反应。炎症通路的激活由模式识别受体(PRRs)介导,如核苷酸结合寡聚结构域(NOD)样受体(NLRs)、Toll样受体(TLRs)、视黄酸诱导基因I (RIG-I)样受体(RLRs)和肿瘤坏死因子受体(TNFRs),导致下游核因子κB (NF-κB)和丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路的启动和促炎细胞因子的产生。

  机体消除有害病原体,促进组织恢复,为免疫记忆铺平道路,炎症反应是必不可少的。然而,过度的炎症反应已被认为是癌症、心血管疾病和许多其他疾病的原因。特别是,2019冠状病毒病(COVID-19)患者重症监护病房(ICU)的入院和死亡与细胞因子风暴综合征密切相关,其特征是大量炎症细胞因子的大量释放。因此,炎症的及时化解和快速激活同样重要,这说明有效而精确的调节炎症反应对于宿主消灭病原体和维持稳态至关重要。近年来,越来越多的研究发现了几个关键的调节参与炎症化解过程。然而,炎症反应的调控仍不清楚,需要进一步研究。

  哺乳动物SWI/SNF染色质重塑复合物是一种依赖于ATP的多亚单位工厂,动态调节基因组DNA的可及性。该复合物由多达15个亚基组成,包括一个催化ATP酶亚基(SMARCA4/BRG1或SMARCA2/BRM)和其他三个核心亚基(SMARCB1/BAF47、SMARCC1/BAF155/SRG3和SMARCC2/BAF170),它们几乎在体外重建了整体复合体的整个重塑功能活性,并且是所有SWI/SNF复合体所必需的。

  与传统的染色质重塑复合物一样,SWI/SNF复合体参与DNA复制和转录,因此参与许多重要的细胞过程。复合物结构分析证实,SMARCC1亚基作为SWI/SNF复合物中碱基模块的支架,并与所有其他碱基亚基结合,表明SMARCC1在SWI/SNF复合物组装中发挥重要作用。值得注意的是,最近的一项研究通过全基因组CRISPR筛选显示,SMARCC1是严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染最不可或缺的宿主因子之一。然而,SMARCC1在炎症反应中的具体功能及其潜在机制尚不清楚。

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文章模式图(图源自Cell Reports )

  泛素化是一种最普遍的翻译后修饰(PTMs),调节无数的细胞过程,包括先天免疫反应。泛素以Lys-6、Lys-11、Lys-27、Lys-29、Lys-33、Lys-48和Lys-63多泛素链的模式附着在其底物上,导致其功能多样性。泛素-蛋白酶体系统(UPS)由E1泛素活化酶、E2泛素偶联酶和E3泛素连接酶组成,是促进蛋白质降解的基本分子机制。值得注意的是,E3泛素连接酶因其解释了底物的准确性和特异性而备受关注。根据其结构域,E3泛素连接酶可分为三类:Really Interesting New Gene(RING)家族、与E6AP C端同源(HECT)家族和RING-between-RING (RBR)家族。环家族的E3s直接催化泛素从E2 ~泛素转移到底物,而其他两个家族的E3s介导修饰,泛素从E2转移到E3,然后转移到底物。

  一些生化研究表明,蛋白酶体在破坏SWI/SNF复合体的稳定中起作用,因为关键SWI/SNF亚基的降解和其染色质重塑活性的抑制。然而,RING E3s是否可能通过SWI/SNF亚基的泛素化而对炎症反应进行负调控还有待进一步研究。

  在本研究中在巨噬细胞中功能筛选了103个小鼠RING结构域E3s,并确定RNF138作为SWI/SNF依赖方式的晚期炎症反应的负调控因子。该研究证明,核RNF138介导K48连接的多泛素化,并促进SWI/SNF复合体核心亚基SMARCC1在先天反应中的蛋白酶体降解。总之,该研究数据表明RNF138在微调SWI/SNF调控炎症基因的动力学方面具有调节作用。

  最后,iNature编辑部结合Pubmed及Web of Science发现曹雪涛团队从2014年到2023年(截至2023年3月25日)在Nature (2篇),Science (4篇),Cell (3篇),Nature Immunology(8篇),Cancer Cell(5篇),Nature Reviews Immunology(2篇),Immunity(4篇),Cellular & Molecular Immunology(19篇),JOURNAL OF AUTOIMMUNITY (13篇),Cell Research (6篇),Cell Reports(6篇),PNAS(8篇),Nature Communications (9篇),Signal Transduction and Targeted Therapy(5篇),JOURNAL OF IMMUNOLOGY(5篇),Oncoimmunology(7篇),Hepatology(3篇),Protein Cell (3篇)及JOURNAL OF EXPERIMENTAL MEDICINE (4篇)等发表164篇文章(仅包括综述及研究论文,通讯作者的有117篇文章)(文章后附列表),专注于免疫领域。另外,由于时间匆忙,如有错误,可向编辑部反馈。下面是164篇文章列表:

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