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Nature Genetics:GWAS和Hi-C技术解密全新癌症相关基因

2017.6.15

  睾丸癌是最常见的年轻男性癌症。铂类化疗是较为成功的治疗手段,但仍有少部分男性对其缺乏反应。一般患者的初次确诊年龄在二三十岁,这意味着他们今后的人生不得不忍受长期化疗带来的副作用。

  伦敦癌症研究所(ICR)的科学家们调查了3万名男性DNA,发现了19种与睾丸癌有关的新基因变异。结合先前鉴定的遗传因素,研究人员受试者中挑选出了1%的高危人群。这些男性一生中患睾丸癌的风险约为7%,是普通男性(约0.5%)的14倍。

  这项由Movember资助的研究,发表于6月12日的《Nature Genetics》,文章指出的风险基因的激活方式为潜在的新型疗法提供了线索。

  研究结果与同期《Nature Genetics》的另一篇名为“Meta-analysis of five genome-wide association studies identifies multiple new loci associated with testicular germ cell tumor”( 接收时间2017年4月27日)同属一个领域,但是后者比其接收时间早19天。虽然提交和接受时间较晚,但是ICR研究组发现的新基因变化在数目上比后者多7个(本文19个新loci,后者12个新loci)。

  这两项新发现共同推动了高危人群检测临床试验发展,为预防性治疗或检测提供依据。

  ICR的研究小组将7319名男性睾丸癌患者DNA与来自三项不同项目的23082名未患该病的男性DNA样本进行比较。通过详细阅读这些人的DNA密码,研究人员从中挑出增加睾丸癌风险的DNA碱基变化。

  至此,与睾丸癌相关的基因变化标志(包括SNPs和候选因果基因)增至44个。科学家们可为三分之一的睾丸癌遗传风险找到DNA密码解释。

  研究人员还详细地研究了新发现的可导致癌症的遗传错误,及其细胞内发病机制。

  他们发现,许多基因变异通过干扰细胞内基因活化制造睾丸癌发病风险。那些似乎特别容易受影响的基因或是参与了染色体稳定,或是与著名的KIT癌基因(KIT–MAPK信号通路)有互动。

  项目带头人、ICR遗传学和流行病学高级研究员Clare Turnbull博士说:“我们的研究使与睾丸癌风险相关的基因变异数目几乎增加了1倍,提高了遗传学预测疾病的能力。虽然这是一项不错的成绩,但是仍有更多基因变化影响着疾病风险,还需要进一步研究去了解影响着细胞生物学和癌症发展的随时间变化的遗传学变化。”

  伦敦癌症研究所的首席执行官Paul Workman教授说:“大规模遗传学研究是我们战胜癌症的关键组成部分,我们对癌症遗传学了解越多,就越能在发病前挑出最危险的人。”

  除了早期筛查,这项新研究还调查了疾病的生物学特性,即促细胞癌变原因。“缩小治疗靶点搜索范围,能帮助对铂类化疗无反应的患者摆脱疾病困扰,”Movember 基金会项目主席Paul Villanti补充说。“这项研究为挽救治疗失败的男性患者群体构建了通往新治疗的途径。”

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