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植物基因组DNA提取、酶切及电泳分析

2020.7.27

一、目的
 掌握植物基因组DNA提取的一般方法及注意事项。大分子量DNA分子的酶切分析。

 二、原理
 十六烷基三乙基溴化胺是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的,当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3
 mol/L
 NaCl)时,从溶液中沉淀,通过离心就可将CTAB与核酸的复合物同蛋白质、多糖类物质分开,然后将CTAB与核酸的复合物沉淀溶解于高盐溶液,再加乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇。

 三、试剂与器材
 (一)、试剂
 1 、DNA extraction :500ml
   31.885g  sorbitol (山梨醇)
   6.05g    tris   PH8.2  (一般不调)
 2、Nuclei lysis buffer: 500ml
   100ml       1M  Tris PH7.5
   100ml       0.25M  EDTA
   200ml       5M    NaCl
   10g         CTAB
   100ml       ddH2O
 3、5% sarkosyl (N-月桂酰肌氨基钠盐)  500ml
    用时,将上述三种溶液按1:1:0.4 比例混匀,加入亚硫酸氢钠(3.8g/l),65℃预热,既为抽提液。
 (二)器材
     恒温水浴、研钵、电泳设备

 四、操作步骤
 (一)、基因组DNA提取
 1
 取0.15g左右小麦叶片,在液氮中研磨后放入1.5ml离心管中,加入700ml抽体液(65℃预热)混匀,放入65℃水浴中,裂解40-60分钟,期间温和混匀几次。
 2 取出裂解好的DNA ,加入700ml氯仿:异戊醇(24:1),猛烈混匀,离心(1000rpm,10分钟)。
 3 取上清于新管中,(不要混入氯仿),加入0.8-1倍预冷异丙醇,缓慢混匀后,再猛烈混匀,使DNA成团,-20℃放半小时以上。
 4 将析出的DNA 离心,14000rpm,10分钟。
 5 去掉上清,将沉淀用1ml 70% 乙醇清洗一次,离心 干燥,溶于50ml ddH2O。

 (二)、酶切及电泳分析
   取四支1.5ml离心管,分别写上标记:g/EcoRⅠ(学号)、g/HindⅢ(学号)、λ/EcoRⅠ(学号)和λ/ Hind Ⅲ(学号)。
   前两支试管加入30 ml基因组DNA。后两支试管加入3mlλ基因组DNA。
   前两支加入5 ml 10×buffer。后两支加入2ml 10×buffer。
   前两支分别加入ddH2O 12.5ml,后两支分别加入ddH2O 13ml
   分别加入RNase 1 ml。
   前两支试管分别加入1.5 ml  EcoRⅠ和Hind Ⅲ,10000rpm离心20 S混匀。前两支试管分别加入1 ml EcoRⅠ和Hind
   Ⅲ,10000rpm离心20 S混匀。
   37℃反应4h
   0.8%琼脂糖凝胶电泳(样品全部点样)。
   观察记录并分析实验结果

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