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RNA的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE; polyacrylamide gel electrophor...

2020.9.01

一、原理

核酸(ribonucleicacid,RNA)分子在一定pH值的缓冲液中带有电荷,将其放入电场中,可向与其所带电荷电性相反的电极移动。聚丙烯酰胺凝胶具有分子筛效应,核酸分子大小、形状不同,故在电场作用下,核酸分子在聚丙烯酰胺凝胶中泳动速度不同,依此可达到分离纯化的目的。

二、材料、仪器设备及试剂

材料:RNA样品液。

(二)仪器设备:1. 电泳仪;2. 玻璃管;3. 试管架;4. 穿刺针头;5. 注射器。

(三)试剂:1. 20%的单体母液:取重结晶的丙烯酰胺19.0g及甲撑双丙烯酰胺1.0g,蒸馏水溶解,稀释至100ml。2. Tris-硼酸-EDTA(TBE)缓冲液:称Tris108.8g,硼酸55.0g,EDTA-Na29.3g蒸馏水溶解,稀释至 1000ml,pH=8.3。用于电极缓冲液时再稀释10倍。3. β-DMAPN(二甲基氨基丙腈)4. 1.6%过硫酸铵溶液:称取0.16g过硫酸铵溶于10ml水中。5. 20%蔗糖-0.2%溴酚蓝溶液:取蔗糖20g,溴酚蓝0.2g溶于100ml水中。6.0.2%甲烯蓝染液:取0.2g甲烯蓝溶于100mlpH4.7 的0.4mol/L Hac缓冲液中,过滤后使用。7.6%Hac液:取HAc60ml加水至1000ml。

三、实验步骤

(一)制胶:1. 取玻管(8cm×0.5cm)2支,下端用胶布封闭管口,垂直立在试管架上;2. 取单体母液3ml,缓冲液1.5ml,β-DMAPN0.06ml,水10ml混匀,再加过硫酸铵0.94ml,混匀后立即分装于各管至刻度处,沿玻管加几滴水封面,静置待凝固。

(二)加样:1. 取少量RNA样品液和RNA标准液分别加入等体积的20%蔗糖-0.2%溴酚蓝;2. 剥去凝胶管下端胶布,倒出凝胶表面水,用电泳缓冲液洗涤凝胶表面三次,凝胶管内加满缓冲液,插入电泳槽中,上下槽加足电泳缓冲液,每支凝胶管加RNA样品 10~20μl(含RNA50~100μg)。

(三)电泳:接通电泳仪电源,上槽接负极,下槽接正极。开始时电流应小一些,以 1~2mA为宜。待样品进入凝胶后增加至每支凝胶3mA,调至所需电流并保持。待溴酚蓝至凝胶管下端2cm处关闭电源停止电泳,取出凝胶管。

(四)染色及观察:1. 用5ml注射器吸满蒸馏水,安上穿刺针头,针尖紧贴玻管壁,边旋边向凝胶管侧壁注入水剥离凝胶;2. 将凝胶放入染色液中染色1h,再用6%Hac脱色,更换数次脱色液,直到背景清晰,一般需脱色24h;3. 将凝胶泡在6%Hac中,取出后在紫外灯下观察,比较不同样品的电泳区带。


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