返座假基因的机理
对于许多已知的返座假基因，如肌管蛋白假基因、肌动蛋白假基因、葡萄糖-3-磷酸脱氢酶等等，它们的功能基因能够在非分化细胞（如生殖细胞和非分化的肿瘤细胞）中表达。这些返座假基因的长度和多聚腺嘌呤尾提示着它由RNA聚合酶Ⅱ转录而来。上面提到的异常转录本（如人免疫球蛋白ε及λΨ1假基因和鼠Ψα3-珠蛋白假基因被认为可能是由RNA聚合酶Ⅲ转录而来。Mathias等认为有自主返座能力的长散布重复序列L1产生的蛋白质能够作用于Alu转座子及细胞的mRNA（如返座假基因）并促进其返座。Luan等在对昆虫非长末端重复元件（non-LTRelement）R2BM的研究基础上，提出了目标引导反转录（target-primedreversetranscription，TPRT）的返座机制。尽管一些资料已证实这种机制，但所提出的返座途径的具体步骤仍存在未解决的问题。
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