Ultima Genomics联合英伟达挑战基因测序巨头
测序技术新人 Ultima Genomics 近日表示，它已与英伟达合作以加速基因组分析。
总部位于加利福尼亚州纽瓦克的 Ultima 一周前从隐身模式中脱颖而出，获得了 6 亿美元的资金支持，并表示计划在明年初推出一个高通量 DNA 测序平台。该公司还发布了一份 BioRxiv 预印本，详细介绍了其新颖的合成测序方法，声称该方法可以将人类全基因组测序的成本降低到 100 美元，这可能成为因美纳的 NovaSeq 高通量平台带来真正的竞争。
通过新的合作伙伴关系，该公司将把英伟达图形处理单元嵌入到其 UG 100 高通量下一代测序仪器中，这些仪器目前处于早期测试阶段。 英伟达A30 GPU 与英伟达的 Clara 人工智能计算平台相结合，可加速对来自 UG 100 单元的数据进行一级和二级分析。
Ultima 表示，与 Google 的 DeepVariant 变体调用者单独合作的模型可以在英伟达的 Clara Parabricks 平台上运行，以进行进一步的二次分析。
“Ultima 的使命是不断扩大基因组信息的规模，”Ultima 首席执行官 Gilad Almogy 在一份声明中表示。 “我们独特的架构通过结合多种技术进行扩展，因此我们很高兴与英伟达合作，利用他们的 GPU 和 AI 加速平台，为高质量排序和加速计算提供动力，从而降低客户的总拥有成本。”
英伟达基因组学联盟全球总监 George Vacek 表示，Ultima 合作展示了英伟达技术是如何设计用于加速大容量数据处理的。 “Nvidia GPU 在 UG 100 中提供了高度的板载计算能力，并且可以通过 Clara Parabricks 在下游加速数据分析，通过更高吞吐量和更低成本的分析实现大规模数据计划，”他说。
