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Nature Methods发布高通量细胞脂质检测新工具

2017.10.26

  脂类,是一种复杂的物质,除了主要成分脂肪酸还包括许多其他成分。在生命体中,脂质构成细胞壁,储存能量,在必要时释放能量,并在细胞信号转导中起重要作用。有关脂类的很多知识都还没有答案,用质谱测绘大量样本的高通量脂质分子结构检测方法研究还处于初级探索阶段。

  越来越多证据表明,脂质成分变化在癌症、脂肪肝和多发性硬化症等疾病中起因果作用。粗略估计,生命体中大约有30万种不同类型的脂质。为了检测指示疾病的脂质,通常进行正常和患病样本的定量比较分析。这种比较一般需要可靠和详细的脂质组成和结构信息。

  《Nature Methods》发表文章,报道由BioTechMed-Graz倡议开发的最新脂质成分结构分析工具——脂质数据分析器(Lipid Data Analyzer)。

  目前,通过光谱数据可以提供一些鉴定脂质类型、种类、脂肪酰基链类型和位置的信息。然而,同种脂类的测量光谱数据也会有所不同,这是因为在质谱中显示不同脂质片段取决于质谱仪和电离设置。出于光谱的多样性,迄今为止还没有一种普遍适用于自动检测脂类结构的生物信息学软件。

  格拉茨科技大学计算生物技术研究所的Gerhard Thallinger解释:“快速、可靠的细胞样本脂质组成检测是比较疾病生物标志物特征的前题。一个首先要解决的问题是,哪些脂质组成变化与诊断有关?”

  脂质数据分析器使用直观的规则集解释脂质光谱,可以灵活地适应各种碎片特征。首次解决了脂质精确结构的稳定检测问题。

  在这篇文章中,研究人员使用脂质数据分析器检测到了100多种以前没有报道过的新脂类物质。该款软件现已开放源代码供科研人员下载。而且,它不仅适用于脂质识别,还可灵活地应用于多糖和糖脂(与糖相连的脂质)的表征。

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