发根农杆菌用于获得转基因植物和培育作物新品种
对Ri质粒T-DNA进行改造，可以构建出新的具有目的基因和标记基因的Ri质粒，用改造型Ri质粒的发根农杆菌感染植物细胞，可以将目的基因导入植物组织，并可再生出转基因植物，所以发根农杆菌为遗传工程改良植物抗性和品质提供了一条十分有效的途径。1985年，Ooms等用发根农杆菌转化甘蓝型油菜的子叶，得到转基因油菜，其皱叶等异常表型可以遗传。同年，Arlette等用发根农杆菌Ri质粒的T-DNA转化胡萝卜，烟草，牵牛等植物叶片，从遗传转化的毛根再生出完整植株。Comai等用含沙门氏杆菌aroA基因的pRiA4的TL-DNA的发根农杆菌转化烟草，获得耐草甘膦(Glyphosate)的转基因植株。Robaglia等用含nptⅡ基因的中间载体的发根农杆菌转化烟草，获得抗卡那霉素的转化根与再生植株。1989年，何玉科用发根农杆菌转化甘蓝型油菜等作物，获得了含其T-DNA的转化根；用发根农杆菌LBA9402的遗传转化作用，从甘蓝下胚轴切段诱导出含T-DNA的转化根，并由其再生出小植株。1988年，张荫麟用发根农杆菌15834感染赛莨菪叶片，获得产生生物碱的转化根；1992年，他又用发根农杆菌感染金荞麦无菌苗，诱导出发根。1999年，王冲之等用发根农杆菌15834感染西洋参无菌苗切段获得发根，PCR分析证实ro1C序列整合入转化植株的染色体组。
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