等位基因特异性PCR技术的研究发展
ASPCR的发展，主要是围绕提高3’末端碱基错配分辨率来进行的。为了提高ASPCR对末端碱基错配的分辨力，人们尝试了许多方法。比如：改换另一条链进行分析以规避这些错配延伸率高的碱基组合；把控制PCR反应的关键成分稀释到接近极限的浓度；在检测用引物的3'末端附近人为引入新的错配；截短Taq DNA聚合酶；利用正配碱基、错配碱基掺入的动力学性质的差异，用腺苷三磷酸双磷酸酶(apyrase)来增强这种差异，从而使信噪比大大提高；以及利用人工修饰的碱基作为3’末端碱基来抑制错配延伸率等等。
早期的改进方法
Bottema 等（1993）提出两个解决方案：一是设计引物时，如果引物3'末端可能与样品模板形成延伸率高的碱基错配，那么可以考虑以其互补链作为模板，从而避开这些高延伸率的错配。二是把控制PCR反应的关键成分稀释到接近极限的浓度。由于错配延伸效率毕竟比正配延伸要差，在扩增资源极低的情况下，错配延伸即使发生，也达不到可被显示出来的水平，因此避免了假阳性结果。但是，这两种方案都需要大量实验来对实验条件进行摸索优化，因此目前已较少被采用。
近期改进方法：
1. 在3‘末端附近引入额外错配
2. 腺苷三磷酸双磷酸酶介导的等位基因特异PCR法(apyrase-mediated allelespecific extension, AMASE)
3. 焦磷酸解激活的聚合反应法(Pyrophosphorolysis-activated polymerization, PAP）
4. 改进酶效率
5. 锁定的核酸技术(locked Nucleic Acid, LNA)
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