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浙江大学携手华裔牛人发表表观遗传学新技术

2015.11.09

  理解染色质修饰在发育和疾病中的调控作用是非常重要的,不过这样的研究往往会受到样本量的限制。基于染色质免疫共沉淀的深度测序(ChIP-seq)近来在这一领域取得了一定进展,但要实现高质量的图谱分析还面临着不少挑战。

  浙江大学和卡内基科学研究所的研究人员开发了两项新技术,RP-ChIP-seq(recovery via protection -ChIP-seq)和FARP-ChIP-seq(favored amplification RP-ChIP-seq)。这两项技术只需500个细胞就能进行可靠的表观基因组分析。这一成果发表在十一月五日的Cell Reports杂志上,文章的通讯作者是浙江大学生命科学研究院的贾俊岭教授和卡内基科学研究所的著名华人学者郑诣先( Yixian Zheng)教授。

  研究显示,RP-ChIP-seq可以在一个小鼠晶状体中检测衰老相关的表观遗传学改变。而FARP-ChIP-seq能够在小鼠的长期造血干细胞(long-term HSC)、短期造血干细胞(short-term HSC)和多能前体细胞(MPP)准确地同时定位组蛋白修饰H3K4me3和H3K27me3。

  在细胞分化过程中,H3K4me3/H3K27me3双修饰的二价状态,会变成H3K4me3或者H3K27me3单修饰状态,进而调控基因的表达情况。这项研究表明,HSC中的造血分化基因缺乏H3K4me3/H3K27me3二价状态。

  作者简介:

  贾俊岭 博士 浙江大学生命科学研究院教授、研究员、博士生导师。教育背景与工作经历:12/2013-Present 教授/研究员 浙江大学生命科学研究院;10/2008-12/2013 博士后 卡耐基研究所/霍华休斯医学研究所(巴尔的摩.美);08/2003-10/2008 博士 贝勒医学院(休斯顿.美)获John R. Kelsey, Jr. Award奖;09/1999-07/2002 硕士 中国预防医学科学院.病毒学研究所 (北京);09/1993-07/1997 学士 沈阳药科大学.微生物制药专业

  郑诣先 教授1984年毕业于四川大学生物学系,在西南农业大学执教近3年后赴美国俄亥俄州立大学攻读分子遗传学博士学位,在果蝇中发现一个与微管蛋白(gamma tubulin,对细胞结构与基本功能至关重要)有关的基因(gamma tubulin in Drosophila and humans, Cell, 1991)。随后在美国加州大学旧金山分校做博士后,师从Bruce Alberts教授(美国国家科学院院长),分离和鉴别了r-微管蛋白环形复合体(gamma tubulin ring complex,Nature,1995)。后赴美国卡耐基科学研究所任研究员至今,兼任美国约翰霍普金斯大学生物系教授。

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