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曹雪涛院士Science揭示重要非编码RNA

2014.4.21

  来自第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院的研究人员,发现一种名为lnc-DC的长链非编码RNA控制了人类树突状细胞的分化。

  领导这一研究的是我国著名的免疫学家曹雪涛(Xuetao Cao)院士。其现任职第二军医大学、中国医学科学院和浙江大学医学院,主要从事肿瘤免疫治疗和分子免疫学方面的研究,曾在树突状细胞的免疫学和肿瘤的免疫与基因治疗研究方面获得重要成果,以通讯作者的身份在Nature Immunology、Nature Communications、Immunity等国内外知名杂志发表论文200多篇。2013年当选为Cell杂志的新一届编委。

  长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,起初研究人员发现它们并不编码蛋白,因此将它们认作为是基因组转录的“噪音”,不具有生物学功能。然而,近年来的研究发现,lncRNA参与调控了机体的生长发育、细胞凋亡、增殖、分化等,与多种疾病密切相关。但到目前为止还只报道了少数调控免疫系统的lncRNAs。

  树突状细胞(DCs)是哺乳动物免疫系统中最有力的抗原递呈细胞;它们的分化和功能对先天免疫和适应性免疫应答具有重要的影响。尽管已经确定了一些转录因子和细胞因子在DC细胞群的生成与稳态中发挥至关重要的作用,对于在DC分化和功能中起作用的非编码RNA,尤其是lncRNAs仍然知之甚少。

  不同于microRNA已经确立的作用机制:是基于种子序列互补配对,对于lncRNAs的作用机制仍未充分理解。少数的lncRNAs是通过与细胞核中的异核蛋白或染色质修饰复合体相互作用来发挥功能,而另一些则是通过影响细胞质中的mRNA稳定或转录。目前尚不清楚是否还存在其他未知的 lncRNAs作用模式。

  在这篇新论文中,研究人员利用广泛接受的、诱导外周血单核细胞分化为人类树突状细胞的模型,进行转录组微阵列分析(使用了Affymetrix公司的Human Transcriptome Array 2.0 芯片)和RNA测序,鉴别出了唯独表达于人类DCs中的一种长链非编码RNA: lnc-DC。他们证实抑制lnc-DC可破坏体外人类外周血单核细胞以及体内的小鼠骨髓细胞分化为DC,并减小了DCs刺激T细胞激活的能力。

  进一步的机制研究证实,lnc-DC是通过激活转录因子STAT3来介导这些效应的。lnc-DC直接结合到细胞质中的STAT3上,通过阻止STAT3结合SHP1及被去磷酸化,促进了STAT3 tyrosine-705位点磷酸化。

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