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检测大多数常见病原菌的快速工具

2019.5.10

图片:基于微阵列的新型Prove-it骨与关节测定产品(图片蒙Mobidiag公司惠赐)。

图片:基于微阵列的新型Prove-it骨与关节测定产品。

一种基于微阵列的新测定产品,可检测60多种常见革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌,包括直接用骨关节样本检测耐受mecA、vanA和vanB的基因。

研究人员比较了这套诊断平台检测培养物阳性样本的结果与细菌培养物和自制广谱细菌聚合酶链反应(PCR)的结果,以评估其性能。全面的评估不仅包括骨关节样本,还包括取自其它无菌部位的样本。

瑞士巴塞尔大学医院的临床微生物学家在2012年1月至5月期间收集了住院病人的临床样本。总共200份样本中,120份取自骨关节器官(65份活检样本、42份植入物和13份抽吸物),其余80份样本来自胸膜、腹水、脑脊液(CSF)、肺、胰、胆囊、心脏瓣膜以及心内或乳房假体等部位(40份活检样本、27份抽吸物、6份植入物、5份CSF样本和2份其它类)。

按照标准协议培养需氧菌和厌氧菌,包括用巯基乙酸盐培养基富集培养物。执行广谱细菌PCR,在应用生物系统公司的ABI 3130毛细管测序仪上对产生可见PCR产物的样本进行测序。用芬兰赫尔辛基Mobidiag公司的Prove-it骨与关节测定产品检验DNA萃取物。

129/176 (73.3%)的样本中分离出一种微生物,称为单微生物样本,47/176 (26.7%)的样本中分离出一种以上的微生物,称为多微生物样本。Prove-it骨与关节测定作用于单微生物骨关节样本的灵敏度是62.6%,作用于非骨关节样本的灵敏度是52.2%。如果计算中只包括含有试剂盒中菌种的样本,那么两类样本的灵敏度分别为72.2%和68.6%。Prove-it测定正确预测出接受表现型敏感性测试的全部66份样本的甲氧西林耐受性/敏感性。在两份样本中检测到金黄色葡萄球菌和mecA基因的阳性信号。一份样本确实含有耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)菌株,而另一份样本含有甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林表皮葡萄球菌。

该研究的论文发表于2014年12月的《微生物学方法杂志》(Journal of Microbiological Methods)。作者总结说,Prove-it骨与关节测定是速度极快的诊断工具,能在早期等待培养法的明确结果时揭示最常见病原体的类型,不仅是骨关节中的病原体,而且是其它原发无菌样本中的病原体。虽然这项测定只能检测Prove-it试剂盒里存在的几个菌种,但它也许可替代广谱细菌PCR。


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