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弯曲条带该如何进行处理?

2020.5.05

如果你曾经做过SDS-PAGE和Western blotting实验,你肯定会看到弯曲的或模糊的条带,不同于你的抗体数据表上显示的那些完美的条带形状。虽然这些弯曲的条带本身并不吸引人,但它们会影响到分子量,这可能会影响到条带密度测量的分析,尤其是在使用自动化程序或分析分子量相近的蛋白

不要担心,通常您可以采取五个非常简单的步骤,使您的完美印迹再次呈现。

清洁实验器材

你花了几个星期的时间来培养你的稀有细胞,用昂贵的新化合物来处理它们,小心地收集和溶解你的样本,然后却把你的凝胶放在两个脏的玻璃板之间。所以要确保你的玻璃板和梳子在铸造之前是干净的,这是确保你铸造完美凝胶非常重要的一步骤。

摇动和搅拌

凝胶铸造的一个主要问题是不适当的混合试剂,特别是丙烯酰胺。为了确保在凝胶中均匀地分离蛋白质,需要确保一个恒定的丙烯酰胺百分比。但同样的,你也要尽可能快地将配好的胶用于实验。一次彻底的混合凝胶试剂,接着是同样重要的脱气步骤,每次都能给你纯洁的凝胶。

保持试剂新鲜

相同的方式,缓冲buffer确保它们是新鲜的,重要的是调整到正确的PH值。我们经常发现我们的western blotting是重复不出来,使用将近6个月不新鲜的缓冲buffer,并将buffer一直放在阳光下,可能把buffer扔掉重新配置更有意义。 至少要检查一下buffer的pH值是必须的,因为它在您的蛋白质迁移中通过凝胶发挥重要作用。

低电压慢跑

如上所述,我们知道你希望尽快获得令人兴奋的结果,以高电压运行您的凝胶可能会导致您不得不再配胶并重新运行样品。 通过在高电压下运行你的凝胶,缓冲液和凝胶会变热,这是您的凝胶翘曲和弯曲的主要原因。

上样要适中

减少关于条带弯曲和更多关于印迹,这一步对于确保您从印迹获得最准确的结果至关重要。 尽管在最大体积中加载最大浓度蛋白质是有诱惑力的,但有时候减少上样量,可以确保您获得一个不错的条带而不是无法辨认的印迹。使用新的抗体,甚至是新的抗体批次,需要运用总蛋白质标准曲线进行测试。 这个简单的步骤可以节省您的时间和样品,使您的分析更快捷。


在这五个步骤之后,你可以让你的条带变得锐利,让它们成为你的实验室的骄傲。


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