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用线性连续蔗糖梯度快速分离原核细胞的核糖体亚基

2020.7.14

大肠杆菌(E. coli )的核糖体(70S,M=380万)由50S (M=180万) 大亚单位及30S小亚单位 (M=90万)组成,用简单的直线型5—25%蔗糖梯度(在缓冲液中调制)。合适的缓冲液(0.2mM 醋酸镁,10mM  Tris—HCL 及60mM 氯化铵)有利于稳定70S核糖体并有利于50S及30S 亚基的分离
设备
各型超速离心机(以日立CP—MX为例)但加/减速速率档次必须在5/5以上,日立STF2封管器,取出梯度用日立DGF—U与带流动他的分光光度计配套,自动分部收集器等)
转头
各种垂直管,角式及水平转头均可完成此实验,本文以日立P65VT2 垂直管转头(65000rpm,416000xg,16×5ml)和PS65T水平转头 (65000rpm,419000xg,            3×5ml)为例
离心管
P65VT2 5PA 密封管(加满液体后用日立STF2 自动封管器熔封) P65ST 用5PA 薄壁管(梯度液及样品加至距管口3mm)
梯度液:用缓冲液溶解后调制5—25%直线型蔗糖梯度(可以用25%,20%,15%,10%,5%,五档等分总容积后在离心管中直立过夜形成连续梯度),梯度液上铺0.35 ml 样品
离心参数
P65VT2转头:65000rpm×20分,4℃,加速“5”减速“6”
P65ST转头:65000rpm×45分,4℃,加速“8”减速“8”
结果
1.P65VT2转头:离心后50S亚基OD峰(260mm)在22%蔗糖梯度附近,峰顶距离离心管口约4.5cm,30S亚基OD峰(260mm)在相当于蔗糖梯度16%附近,峰顶距管口约3.2cm
2.P65ST转头:离心后,50S亚基OD峰(260mm)在17%蔗糖梯度附近,距离离心管口约3.3cm,30S亚基峰顶在13%蔗糖梯度附近,峰尖距管口约2.2cm
相比较P65ST的峰更尖锐,分离效果稍优。
讨论:也可以用其他转头,(如P40ST,P56ST水平转头或其他角式转头,但综合比较实验结果以P65ST 和P56ST最佳。)

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