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Co IP Protocol-4

2019.7.06

工作液配制:
配制100ml的modified RIPA buffe:
1. 称取790mg 的Tris-Base,加到75ml 去离子水中,加入900mg的NaCl,搅拌,直到全部溶解,用HCl调节PH值到7.4
2. 加10 ml 10%的NP-40
3. 加2.5 ml 10%的去氧胆酸钠,搅拌,直到溶液澄清
4. 加1 ml 100mM的EDTA,用量筒定容到100ml,2-8℃保存
5. 理论上,蛋白酶和磷酸酯酶抑制剂应该在使用当天同时加入(抑蛋白酶肽,亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂各100 μl; PMSF, Na3VO4, NaF各500 μl),但是PMSF在水溶液中很不稳定,30分钟就会降解一半,所以PMSF应该在使用前现加,其他抑制剂成分可以在水溶液中稳定5天。
各种成分在工作液中的终浓度:
  Tris-HCl: 50 mM, pH 7.4
  NP-40: 1%
  去氧胆酸钠:0.25%
  NaCl: 150 mM
  EDTA: 1 mM
  PMSF: 1 mM
  抑蛋白酶肽,亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂: 各1 μg/ml
  Na3VO4: 1 mM
  NaF: 1 mM

通过免疫共沉淀确定结合蛋白
1.用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的适宜细胞。刮去每块板上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中。
2.将每毫升细胞悬液转移到微量离心管中,在微量离心机上4℃以最大速度离心15 min。
3.收集上清(约30 ml)并加入30μg的适当抗体,4℃摇动免疫沉淀物1 h。
4.加入0.9 ml的蛋白质A-Sepharose 悬液,4℃摇动免疫沉淀物30 min。
5.用含900 mmol/L NaCl的NETN洗蛋白A-Sepharose混合物,再重复洗5次。最后,用NETN洗一次。
6.吸出混合物的液体部分。加入800μl的1×SDS胶加样缓冲液到球珠中,煮沸4 min。
7.将样品加入到大孔的不连续SDS-PAGE梯度胶中,在10 mA的恒定电流下电泳过夜。
8.通过考马斯蓝染色观察蛋白质泳带。
9.从胶上切下目标带,将其放到微量离心管中,用1ml 50%乙腈洗两次,每次3 min。
10. 用胰蛋白酶消化胶中的蛋白质,再将肽电洗脱。
11. 通过窄孔高效液相色谱分离肽。将收集的肽在ABI 477A或494A机器上进行自动Edman降解测序。


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