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流行性脑脊髓膜炎病例的菌群鉴定及分析

2022.2.25

流行性脑脊髓膜炎(epidemiccerebrospinalmen-ingitis,简称流脑)是一种严重的呼吸道传染病,可引起较高的病死率和致残率。即使在医疗条件比较完善的地方,流脑病死率仍高达5%~10%,10%~15%的幸存者会遗留明显的神经系统后遗症(精神异常、耳聋、瘫痪和惊厥等),严重危害人类健康[1]。

脑膜炎奈瑟菌(Neisseriameningitides)是流脑的病原菌,根据荚膜多糖化学结构可将其分为13个血清群,其中A、B、C、W135和Y群是引起流脑的主要血清群,以C群毒力最强[2]。多位点序列分型(multilocussequencetyping,简称MLST)是通过对7个管家基因的测序结果,用核苷酸序列变异来发现细菌型别差异的分型方法[3]。由于脑膜炎奈瑟菌分子型别具有基因多态性,MLST作为一项新型分子分型技术,已被广泛应用于脑膜炎奈瑟菌的鉴定研究[4-5]。中国大陆目前主要流行的脑膜炎奈瑟菌菌群是C群ST-4821[6]。为了解2015年河南省1例流行性脑脊髓膜炎(流脑)病例菌群的分子分型特征,本研究收集患者的脑脊髓液和血液及37例密切接触者的咽拭子和血液,进行多位点序列分型(multilocussequencetyping,MLST),现将结果报告如下。


1.材料和方法


1.1病例信息


男性,14岁,学生,在学校集体宿舍居住,发病前10d外出史不详。2015年9月18日以“头痛、发热”为主诉收住郑州大学第二附属医院。入院检查:T39.5℃,皮肤有淤点和淤斑等症状,并且伴有颈项强直和意识障碍,克氏征和布氏征均为阳性。实验室检查:血液中白细胞总数达到11.6×109个/L,中性粒细胞高达87%,脑脊液呈混浊状态。2015年9月20日死亡。


1.2标本


患者的脑脊液和血液,37例密切接触者的咽拭子和血液。


1.3主要试剂及仪器


脑膜炎奈瑟菌凝集血清购自ThermoFisher公司;2×PremixExTaq和dH2O均购自Takara公司。APINH生化鉴定试纸条购自法国生物梅里埃公司;A群和C群流脑多糖抗体IgG检测试剂盒购自郑州亿特生物技术有限公司;革兰氏染色液购自BASO公司;血培养瓶、双抗和无抗巧克力平板,均购自郑州安图生物工程有限公司;离心机购自Eppendorf公司;CO2培养箱购自ThermoFisher公司;MagNAPureLC2.0全自动核酸分离纯化系统购自Roche公司;荧光定量PCR仪和酶标仪均购自Bio-Rad公司;普通显微镜CX41购自奥林巴斯。


1.4细菌培养及血清学鉴定


①将患者脑脊液沉淀接种于无抗巧克力平板,37℃5%CO2进行培养,24h后进行镜检和生化鉴定。②将患者血培养瓶置于37℃5%CO2进行培养,15h后取培养液涂于无抗巧克力平板再进行培养,24h后进行鉴定。③将37例密切接触者的咽拭子接种于双抗巧克力平板,培养24h,挑取可疑菌落接种于无抗巧克力平板继续培养,48h挑取无抗巧克力平板上的菌落进行镜检和生化鉴定。对确定为脑膜炎奈瑟菌的标本,通过血清凝集试验进行分群。


1.5基因分型。


1.5.1DNA提取


按照使用说明书,通过MagNAPureLC2.0全自动核酸分离纯化系统对患者的脑脊液上清、血液和37例密切接触者的咽拭子进行DNA提取。


1.5.2引物的合成


引物和探针序列参照文献[7],由上海生工生物工程有限公司合成。


1.5.3PCR扩增及产物鉴定


使用脑膜炎奈瑟菌属ctrA基因对患者和密切接触者提取的DNA进行检测,再使用流脑分群引物对阳性标本进行分群。荧光定量PCR反应体系:PremixExTaq(2×)10μL,上下游引物、探针各1μL,DNA模板2μL,dH2O补足20μL体系。以分别含有ctrA基因、C群特异性基因和B群特异性基因的DNA为阳性对照,dH2O为阴性对照。PCR反应程序:95℃2min,95℃5s,60℃20s,共40个循环,在60℃收集荧光信号。Ct值≤35判定为阳性。


1.5.4多位点序列分型引物的设计


参照PubMLST网站上公布的脑膜炎奈瑟菌7个保守基因(abcZ、adk、aroE、fumC、gdh、pdhC、pgm)的引物信息(http://pubmlst.org/neisseria/info/primers.shtml)。PCR扩增之后进行测序,测序结果上传到PubMLST数据库进行分析[2]。


1.6密切接触者的抗体水平


按照试剂盒说明书,用A群和C群流脑多糖抗体IgGELISA检测试剂盒对37例密切接触者的血清进行流脑A群和C群抗体水平检测。标准曲线以标准品质量浓度值为x轴,以标准品A450nm值的对数值为y轴,通过四参数Logistic曲线拟合建立标准曲线,根据待测样品的A450nm值回算相应的质量浓度值。质量浓度≥2μg/mL则为阳性,具有免疫保护水平。


1.7统计学分析


采用IBMSPSS19.0软件对37例密切接触者流脑A群和C群抗体水平进行Fisher精确检验,P<0.05为差异有统计学意义。


2.结果


2.1细菌培养和鉴定镜检及生化鉴定


结果显示,患者的脑脊液、血液和13号密切接触者的咽拭子标本均培养出脑膜炎奈瑟菌,其他36份密切接触者的标本均未见脑膜炎奈瑟菌生长。血清凝集试验结果显示,患者的脑脊髓液和血液均与C群血清凝集,13号密切接触者的咽拭子与B群血清出现凝集。


2.2基因分型


对于ctrA基因,患者脑脊液、血液和13号密切接触者扩增的Ct值分别为21、24和25;对于C群特异性基因,患者脑脊液和血液扩增的Ct值分别为24和26,13号密切接触者未扩增出曲线;对于B群特异性基因,13号密切接触者扩增的Ct值为28,患者脑脊液和血液均未扩增出曲线。这表明患者为C群脑膜炎奈瑟菌,13号密切接触者为B群脑膜炎奈瑟菌,与血清凝集试验结果一致。多位点序列分型结果显示,患者为ST4821型,13号密切接触者为ST5664型,两者均属于ST4821克隆群。


2.3密切接触者的抗体水平


A群流脑抗体阳性率较高,达91.89%,平均质量浓度为6.50μg/mL;C群流脑抗体水平阳性率相对较低,为21.62%,平均质量浓度为1.73μg/mL。A群抗体水平高于C群,差异具有统计学意义(P<0.01)。


3.讨论


河南省某校的这起流脑事件根据患者的临床症状、流行病学调查以及实验室检测结果,可以确定是一起流脑疫情。对于脑膜炎奈瑟菌的鉴定,PCR与细菌培养相比,具有快速、灵敏度高、通量高等多种优点,能够在短时间内对疑似病例进行检测。另外,当患者使用大量抗生素之后,细菌培养可能无法培养出致病菌,会严重影响实验结果。而PCR技术,只要患者体内存在脑膜炎奈瑟菌特异性核酸基因,就可以完成检测。研究通过细菌培养和PCR两种方法对患者和密切接触者的标本进行鉴定,两者试验结果表明,患者脑脊髓液和血液标本分离的菌株为C群脑膜炎奈瑟菌,密切接触者咽拭子标本分离的菌株为B群脑膜炎奈瑟菌。ST4821克隆群是中国首次出现的一个高致病性序列群,其中包含有多个ST型。通过MLST可以对脑膜炎奈瑟菌进行分子分型[6]。本研究中MLST分型结果显示,患者脑脊髓液和血液标本分离的菌株为ST4821型;其密切接触者咽拭子标本分离的菌株为ST5664型,这与患者致病菌遗传关系相近,同属于ST4821克隆群。通过流行病学调查发现,密切接触者包括患者的同班同学、父母、亲戚和邻居朋友近期都未出现发热、头疼等症状。当地近期也未出现流脑病例。但是患者发病前在流脑一个最长潜伏期(10d)内的外出史不详,无法确定其是否与流脑病人或健康带菌者有过接触。因此,这起流脑疫情并没有发现确切的传染源,可能与外出有关。研究通过对37例密切接触者A群和C群抗体进行检测,发现A群抗体阳性率较高(91.89%),平均质量浓度为6.50μg/mL,具有免疫保护水平;C群抗体水平阳性率较低(21.62%),平均质量浓度为1.73μg/mL,低于免疫保护水平,保护力较差,这也是导致这次突发C群流脑疫情的一个重要因素。因此,需在该地区加强A+C群流脑疫苗的接种,以提高C群流脑的免疫水平,同时也需加强对流脑发病趋势的监测,有效预防流脑的暴发。




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