法医基因分型鉴定分析遭质疑，亲属表示不满担忧
一项新的研究对法医分析中使用的基因区域不揭示医学信息的假设提出了质疑。
在美国，法医基因分型鉴定分析依赖于 20 个高度多态性短串联重复序列 (STR) 的基因分型，称为组合 DNA 索引系统 (CODIS) 核心基因座。 1998 年联邦调查局选择了这些 STR 中的 13 个，因为它们易于 PCR 分析并且与私人医疗信息缺乏已知的联系。 2017 年，另外 7 个 STR 被添加到 CODIS 核心位点。
由旧金山州立大学的 Rori Rohlfs 领导的研究人员发表在美国国家科学院院刊上的新论文中写道：“从法律的角度来看，CODIS 基因型不泄露医学信息很重要。” “如果嵌入医疗信息，授权从某些人身上强制收集 DNA 的法律可能会与州隐私法规或美国宪法相冲突。”
在他们的分析中，Rohlfs 及其同事检查了 CODIS 基因型是否与邻近基因的表达差异有关。
为此，他们检查了 1,000 Genomes Project 队列子集中的 STR 长度变异，以及该变异是否与淋巴母细胞系中基因表达的差异有关。由于千人基因组计划依赖于短读长测序，研究人员不得不根据 STR 与周围 SNP 之间的连锁不平衡来估算 STR 基因型。他们警告说，这种方法的准确性各不相同，对于非欧洲血统的队列和具有更多等位基因的 STR 尤其低。
尽管如此，研究人员还是发现了六个与基因表达水平差异显着相关的 CODIS STR。
最强的信号是 CODIS STR D3S1358 等位基因长度与基因 LARS2 的表达之间的显着负相关。通过额外的分析，研究人员发现 D3S1358 可能与影响 LARS2 表达的变体和在淋巴母细胞中活跃以对 LARS2 产生影响的 DNase I 超敏反应位点处于连锁不平衡状态。
同样，基因 CSF1R 的表达与 CODIS 基因座 CSF1PO 的基因型呈负相关，另外的分析表明 STR 本身可能影响 CSF1R 表达或与一个基因座处于连锁不平衡状态。此外，D18S51 等位基因与 KDSR 表达相关，特别是在千人基因组计划中的约鲁班人中。
研究人员说，这些发现表明，与之前的假设相反，CODIS 基因座可以提供特征信息，甚至可能提供医学信息。
CSF1PO 是 CSF1R 的进一步内含子，CSF1R 编码参与小胶质细胞调节的细胞因子受体。 CSF1R 中的破坏性突变与白质脑病有关，而相关蛋白的抑制似乎对某些神经系统疾病（如阿尔茨海默病）具有保护作用。此外，CSF1R 表达和剪接的变化与抑郁症和精神分裂症等精神疾病有关。
LARS2 和 CSF1R 同样也分别与 Perrault 综合征和某些皮肤和血小板疾病等疾病有关。
研究人员写道：“这些结果加入了越来越多的工作，表明 CODIS 基因型可能包含比纯粹身份更多的信息，”并补充说，“这些发现引起了人们对 CODIS 档案被扣押、数据库和访问的个人医疗隐私的担忧，以及这些人的遗传亲属。”
-
科技前沿
-
项目成果
-
项目成果
