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基因型鉴定试剂盒使用说明

2020.4.06

试剂盒成分
 
1、 YSY Buffer
 
2、2*PCR Master Mix(使用实验室常用的酶即可,由客户自备)
 
储藏条件:4oC
实验步骤
 
1、细胞与动物组织的准备:
 
1.1 培养细胞准备:
 
以培养密度为 1´106 个/ml 为例,在超净台内取 1ml(内含 300-1000 个细胞);对于某些类贴壁细
 
胞,可直接刮取侧壁细胞,植入已编号的 PCR 管内。
 

  • 血液准备:

 
取适当部位,采集血液 1 ml。
 
       注意:如果样品在 10 分钟内处理,则无需抗凝处理;在高通量采样情况下,如果样品在塑料PCR管内需存放 10 分钟以上,需采用抗凝处理。
 
1.3 哺乳动物组织准备:
 
采集相应部位,剪取 1mm31 ml左右组织放入已编号的 PCR 管内。
 
1.4 斑马鱼尾鳍、果蝇等其他模式动物组织准备:
 
选取尾鳍、翅膀等无损害部位,可通过剪取、穿孔或针刺等方法制备少量新鲜组织,体积约 1mm3
 
即 1 ml
 
2、基因组 DNA 模板的制备
 

  • 加样

  • 10ml 的 YSYBuffer 液分别逐一加入装有组织或细胞的 PCR 管壁(注意勿将枪头碰到组织

 

 
YSY Biotech 基因的故事   让斑马鱼来为您讲述
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样品,防止污染);加样完毕后,将 PCR 管快速离心,确保溶液和组织或细胞均位于 PCR 管
 
底部;
 

  • 制备基因组模板

 

  • PCR 管放入 PCR 仪中,启动 PCR 程序:65℃×30min、95℃×5min、16℃×1min。基因组

 
模板若不立即使用,请放入-20℃保存。
 
3、目标基因的 PCR 扩增(以下试剂请自备)
 
3.1 取用新的 PCR 管,按下列顺序组装 PCR 反应体系:
 
20 m反应体系(产物直接凝胶电泳进行基因型鉴定用)
 
基因组 DNA 模板(步骤 2.2 所得):1 ml
 
2 × PCR Master Mix:10 ml(自备)
 
正向引物(5mM): 1ml (自备)
 
反向引物(5mM): 1ml (自备)
 
超纯水:   7 ml(自备)
 

  • 组装完毕后,将 PCR 管快速离心,确保所有溶液均位于 PCR 管底部;

 

  • 将 PCR 管放入 PCR 仪中,启动客户自行设计的 PCR 程序完成 PCR 扩增。

 
4、PCR 产物验证
 
取 2ml 扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳进行基因型鉴定;若需进一步测序,可将余下的产物直接送测
 
序;若需酶切鉴定,则在经 PCR 产物纯化试剂盒纯化后,用核酸酶内切酶进行酶切鉴定。
 
注:测序公司一般额外收取 5 元钱的切胶费用,请在送测前和测序公司确认无需切胶回收。
 
5、结果阅读(基因突变及突变率分析)
 
如果基因型可由引物特异性识别,则通过将观测 PCR 产物电泳结果确定基因型;通过测序确定基
 
因型的,其测序结果可通过人工阅读测序的色谱图,识别突变等位基因的基因型,确定突变率。核
 
酸内切酶酶切结果可通过对凝胶电泳条带的灰度分析,确定突变率。


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