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深度测序发现细菌中存在大量msRNAs

2013.7.15

  具有调控作用的非编码小分子RNA,调控基因的表达,而microRNAs在真核生物中恰恰提供了一个最好的例子。然而,与真核生物microRNAs相同大小的细菌小RNAs却鲜被关注。近日,韩国庆北国立大学的研究人员,对细菌中的msRNAs(microRNA-size, small RNAs)进行了系统研究*,证实模式菌种中msRNAs的存在。

  研究人员采用小RNA测序技术(联川生物提供测序服务),对大肠杆菌中小RNA进行鉴定,获取了33.2 M小RNA克隆reads。生物信息学分析鉴定出超过400个msRNA种类。筛选出的高表达msRNAs被qRT-PCR和northern杂交所验证。虽然这些RNAs的功能意义尚不得而知,但它们的高丰度表达表明,它们也许在细菌中发挥特殊作用,类似于真核生物中的miRNA。

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