蛋白质组和磷酸化蛋白质组联合分析慢性肾病并...（二）
Figure 2. Quantification and Gene Ontology analysis ofdifferentially phosphorylated peptides and proteins in (5/6Nx + NS)/(Sham + NS)and (5/6Nx + HS)/(5/6Nx + NS) comparison groups.
5、为进一步解析慢性肾病并发高血压的发病机理，作者对鉴定到的磷酸化差异修饰蛋白进行了互作网络分析（PPI）。他们发现在5/6Nx组（肾切除）中Polr2a，Srrm1，Gsta2和Pxn蛋白的连接度最高；而在盐负荷组中Myh6，Lmna和Des蛋白的连接度最高。KEGG通路分析发现肾切除（肾病）组中的胰岛素信号通路，脂肪细胞因子信号通路，肥大型心肌病以及焦点粘连信号通路中的蛋白磷酸化修饰发生变化；而盐负荷引起的蛋白磷酸化修饰变化主要发生在侧索硬化症，mTOR信号通路，嘌呤代谢，剪接体和胰岛素信号通路等。
Table 1. Physiological and metabolic parametersin sham and 5/6Nx rats at week 12 after surgery.
Figure 3. STRING analysis reveals protein interaction networksin renal phosphoproteome in (5/6Nx + NS)/(Sham + NS) comparison group.
Figure 4. STRING analysis reveals proteininteraction networks in renal phosphoproteome in (5/6Nx + HS)/(5/6Nx + NS)comparison group.
6、最后，作者选择了两个感兴趣的蛋白phospho-lamin A 和phospho-phospholamban进行了含量变化检测（western blot）以及其下游基因的表达分析（realtime PCR），验证了组学数据的准确性。
Figure 5. Phosphoryation levels of lamin A andphospholamban as well as expression of their downstream genes desmin andSERCA2a significantly increased in 5/6Nx rats.
小编心得
本文是一篇典型的多组学联合分析揭示病理机制的文章。本文在iTRAQ蛋白质组研究的基础上通过iTRAQ磷酸化蛋白质组分析揭示肾损伤以及盐负荷对肾皮质组织中蛋白磷酸化修饰的影响，发现差异表达的蛋白以及磷酸化修饰改变的蛋白多与代谢过程，信号传导以及细胞增生相关。本研究对病理机制解析以及药物作用靶点筛选提供了强有力的理论支撑，也为后续的研究指明了方向。这篇文章显示了质谱技术在机理机制基础研究中的重要作用：差异表型整体性分析，全面系统性地解析潜在的分子机理。
