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长链非编码RNA: 从科研到临床(二)

2020.5.25

脂类代谢和脂肪生成

最新的研究表明,lncRNA控制肝脏中的脂类代谢,调控脂肪生成,从而维持机体的脂质稳态[9]。APOA1编码蛋白是高密度脂蛋白的重要组分。其反义转录本APOA1-AS可以在体内和体外抑制APOA1的表达。LncRNA NEAT1在脂肪生成过程中调节PPARγ2的可变剪接,它还介导miR-140诱导的脂肪生成。

造血与免疫系统

lncRNA参与造血免疫系统的不同发育阶段和不同激活阶段[3]。例如,Lnc-DC可以促进树突状细胞转录因子STAT3的磷酸化与细胞核迁移,从而调控树突状细胞的分化。在LPS刺激后的人巨噬细胞中,lncRNA PACER表达明显上调,可特异性的激活邻近基因COX-2的表达。另外,lncRNA THRIL与hnRNP因子相互作用,为炎症-细胞因子编码基因TNF的基底水平表达和诱导性表达所必需。

心脏发育与功能

研究人员在心脏发育过程中发现了数百种差异表达的lncRNA,然而目前只有少量lncRNA功能被研究清楚[2]。比如,lncRNA BVHT在心脏中胚层、胚胎干细胞和心肌细胞中都有表达。敲除BVHT严重损害胚胎干细胞产生心肌细胞的能力。另外,lncRNA FENDRR与心脏谱系发育紧密关联。它只表达于心脏中胚层前体细胞,控制着侧中胚层来源组织(比如心脏)的分化形成。

LncRNA与疾病

近年来,虽然lncRNA与疾病的研究已获得初步成效,然而lncRNA疾病整体研究才刚刚起步,需要更多的研究来揭示lncRNA在疾病中的功能,寻找有效的药物靶点和分子标志物。接下来的部分,我们总结了lncRNA在多种威胁人类安全的疾病中lncRNA的研究现状。

肿瘤

从本质上说,肿瘤是一类基因性疾病,通过改变细胞内的信息流,从而改变细胞稳态和促进细胞增殖。癌症全基因组突变分析表明大部分的突变位点位于蛋白非编码区域。这些突变会对lncRNA的表达产生显著影响。LncRNA除了参与肿瘤的恶性转化,还与癌症细胞生长、增殖、侵袭和生存等多种表型有关[6](图三)。比如,在急性T细胞淋巴癌中,癌基因Notch 1诱导lncRNA LUNAR1的表达,从而上调胰岛素样生长因子受体1的表达。在前列腺癌中,PCGEM1, PRNCR1, HOTAIR等lncRNA可以直接激活雌激素受体,而CTBP1-AS等lncRNA则可以捕获雌激素受体抑制蛋白,共同激活雌激素受体信号通路,促进肿瘤增殖。

图三 LncRNA在肿瘤中的作用。 

神经退行性疾病

在大脑发育、神经元功能维持以及中枢神经系统发育过程中,lncRNA也发挥着关键作用。越来越多的证据表明,lncRNA参与阿尔兹海默症、帕金森症和亨廷顿症等多种神经退行性疾病的病理过程[10]。蛋白编码基因BACE1的反义转录本BACE1-AS在阿尔兹海默症病人中高表达。不像其他的反义转录本与其正义链mRNA互补成双链从而抑制其翻译过程,BACE1-AS可以增强mRNA BACE1的稳定性,产生更多的Aβ42。因此,BACE1-AS可能与加速阿尔兹海默症的疾病进程有关。

心血管类疾病

许多lncRNA已被证明可显著影响心脏衰竭和心肌梗塞等心血管疾病[5]。在一个心肌梗塞的小鼠模型中,研究人员发现了两个显著上调的lncRNA Mirt1和MIrt2。这两个lncRNA在发生心肌梗塞24小时候达到峰值,在两天后恢复到基底水平。在另外一个心脏压力过载与心肌梗塞的小鼠模型中,重新激活胎儿心脏的转录组,会导致胎儿心脏增强子相关的lncRNA转录本的高表达,提示这些lncRNA可能在心肌梗塞向心脏衰竭转变过程中发挥关键作用。


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