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小卫星DNA的概念和性能介绍

2022.4.08

小卫星DNA (minisatellite DNA )又称可变数目串联重复(variable number tandem repeat, VNTR),由15~65bp的基本单位串联而成,总长通常不超过20kb,重复次数在群体中是高度变异的。多态性由于重复单位之间的不平衡交换,从而产生不同等位基因,可通过杂交检测出。

VNTR基本原理与RFLP大致相同,只是对限制性内切酶和DNA探针有特殊要求:

(1)限制性内切酶的酶切位点必须不在重复序列中,以保证小卫星或微卫星序列的完整性。

(2)内切酶在基因组的其他部位有较多酶切位点,则可使卫星序列所在片段含有较少无关序列,通过电泳可充分显示不同长度重复序列片段的多态性。

(3)分子杂交所用DNA探针核苷酸序列必须是小卫星序列或微卫星序列,通过分子杂交和放射自显影后,就可一次性检测到众多小卫星或微卫星位点,得到个体特异性的DNA指纹图谱。

小卫星标记的多态信息含量较高,在17一19之间。缺点是数量有限,而且在基因组上分布不均匀,这就极大限制其在基因定位中的应用。VNTR也存在实验操作繁琐、检测时间长、成本高的缺点。

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