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何大澄教授:蛋白质组学已经成为细胞生物学的基础

2013.12.10

  2013年12月8日,由首都医科大学附属北京朝阳医院、AB SCIEX公司主办的第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办,来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动,分析测试百科网作为支持媒体对质谱沙龙活动进行长期报道。

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北京师范大学 何大澄教授

蛋白质组学的四大研究策略

  沙龙期间,来自北京师范大学何大澄教授为我们带来了题为《从蛋白质组学到细胞生物学及其研究策略》的报告。何教授首先指出蛋白质组学已经成为细胞生物学的基础,同时蛋白质组学具有明显的技术性和资料积累性;在谈到蛋白质研究策略中何大澄教授指出,不同策略导致同样技术达成不同的结论和价值,同时海量数据并不能自然转化为知识或智慧。蛋白质组是基因组的逻辑延伸,但研究策略是不同的,报告中何大澄教授介绍了四点关于蛋白质组学的研究策略:

  1、以理解细胞内生命活动为出发点和目标的研究策略;

  2、探寻蛋白质相互作用和调控的网络关系的研究策略;

  3、高度重视动态研究及其策略。蛋白质组学已经成为细胞生物学的基础,动态和体内是蛋白质组学的目前趋势;

  4、蛋白质组学的干预与筛选交替进行的扇形拓展策略。

  随后何大澄教授详细介绍了蛋白质组学的干预与筛选交替进行的扇形拓展策略:干预目标蛋白表达,用组学技术筛选该干预导致的新差异蛋白,交替多轮进行,此研究策略达到的效果:1、有可能找到更多新的包括更好的标志蛋白;2、有可能逐步拼出调控网络中的相关部分(一定意义上类似于测序的拼接)。

蛋白组动态分析技术在用于miRNA研究中的优点

  报告最后,何大澄教授针对近期蛋白组动态分析技术在用于miRNA研究中的优点进行了详细的说明:

  1、由于仅显示15分钟内所合成的蛋白,可排除先已存在的蛋白质的干扰,大大提高动态分析时间分辨率和差异蛋白筛选的敏感性。

  2、由于同位素曝光的高灵敏度,可获得更多蛋白点。

  3、首次获得合成速度/时间曲线,直接指正细胞活动拐点。

  4、具有高通量能力,可同时检测大量差异表达蛋白。

  5、由于是β-衰变,不影响对蛋白质的质谱鉴定。

  6、可用于体内研究

  7、采用追踪等技巧,可以获得蛋白质修饰及降解等扩展信息。

  更多第四十期质谱沙龙文章参见:

  第四十期质谱沙龙活动顺利召开

  何大澄教授:蛋白质组学已经成为细胞生物学的基础

  魏敏吉教授:临床药代动力学研究中的技术方法思考

  刘丽宏主任:洞悉世界先进理念,开展应用型药学研究

  贺玖明副研究员:质谱成像技术的新发展

  罗元明副研究员:生物质谱与蛋白翻译后修饰研究方法学

  李敬来博士:药代发现早期系列化合物的药代特性快速评价

  李春波博士:差异蛋白质组学研究的利器

  更多质谱沙龙活动报道请浏览:http://www.antpedia.com/special/1542-bid-177-zid.html

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