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强强联手--最新蛋白质组学定量技术DIA-PASEF

布鲁克质谱
2019.4.02

多年来,Bruker一直与Matthias Mann教授的实验室深度合作,开发timsTOF Pro蛋白质组学技术。最近,他们与Zuerich ETH的Ruedi Aebersald教授、Ben Collins博士以及多伦多大学的Hannes Roest教授合作,共同研发timsTOF Pro上的最新的DIA技术,称为DIA-PASEF

采用DIA-PASEF技术,不仅大幅提高数据利用率、减少缺失值,而且4D数据的匹配有效降低了假阳性,定量准确性更高、重复性更好,极大地提高了定量分析的可信度,适合于大样本量的定量蛋白质组研究。

DIA-PASEF扫描模式下,有效分离共洗脱肽段,通过质荷比、淌度窗口的隔离筛选母离子。(MatthiasMann教授和Florian Meier博士供图)


  • 高质量谱图库:timsTOF Pro采用双TIMS结构,其独特的时间、空间聚焦优势,促进了灵敏度和数据采集速度的同时提升,并具有更好的谱图归属性,有利于建立更深更好的谱图库。

  • 准确、可重复的CCS值测定:捕集型离子淌度分离提供了精确和高度可重复的碰撞截面(CCS)值,允许在数据处理和软件分析时进行淌度维度的校准和匹配。

  • 4D数据的采集和匹配:独特的4D nanoLC-TIMS-MS分析功能,赋予了DIA-PASEF 4D数据采集和匹配能力。对比传统DIA技术,新增维度--离子淌度信息的匹配,有效降低了数据匹配的假阳性,定量结果更准确可靠。

  • 分析软件:新的DIA-PASEF方法与OpenSwath分析软件相结合,提供了新一代的DIA方法,支持4D谱图库的建立和数据匹配分析,具有深度的蛋白质覆盖率,并具有良好的定量性能。



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