【景杰生物】“Blood+”高深度血液蛋白组,1000+覆盖深度创新升级
图1. 血液中蛋白质含量的数量级分布
为了应对高丰度蛋白的挑战,目前普遍使用的做法是使用试剂盒去除高丰度蛋白,但是由于高丰度蛋白含量极高,抗体试剂盒的去除不可能完全,其残留的蛋白仍然足以对蛋白组检测产生显著的影响。
而另一方面,人们也在通过调整质谱设置的方式进行优化,例如DDA进行HPLC预分级、DIA建立历史库等方式来尽量提高检测深度。但是即便如此,普遍的检测深度仍然多数徘徊在500-600的深度范围[1,2],并且这些方式如果过度使用来一味追求更高检测深度,不但会大大增加成本,而且将对鉴定和定量的可靠性带来负面影响。
基于FAIMS的血液蛋白组检测,相比于传统的方法有一系列的优势。
相比于传统TMT的方法,其不受制于标记通道数的限制,适用性更加广泛;
相比于传统的DDA方法,其不会造成大规模分级而推高的成本;
相比于传统的DIA方法,其在实现蛋白组深度覆盖的同时不会牺牲鉴定的可靠性。
血液标志物研究精选:
创新蛋白质组学
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