T/CHIA 21.3-2021
组学样本处理与数据分析标准 第 3 部分：转录组样本处理
Specification of omics sample processing and data analysis Part 3:transcriptome sample processing
- 标准号
- T/CHIA 21.3-2021
- 发布
- 2021年
- 发布单位
- 中国团体标准
- 当前最新
- T/CHIA 21.3-2021
- 适用范围
- 本标准给出了转录组样本处理过程中的的术语和定义以及相关操作。 本标准适用于转录组样本的处理。
T/CHIA 21.3-2021相似标准
推荐
花生转录组denovo测序揭示果针发育相关的功能基因
另外，约20%的转录本未能与数据库中的任何蛋白匹配，很可能由于这部分转录本是花生特有的转录本。 对于已通过UniProtKB注释的转录本，利用GO对已注释基因的功能进行分类，共有42,995个转录本可比对至GO数据库，且38,280个转录本与分子功能相关，31,152个转录本与生物过程相关，17,881个转录本与细胞组成相关。...
RNA-seq综述（五）
第1阶段-测序读长的比对(alignment)与组装(assembly)测序完成后，分析的起点就是数据文件，这个数据文件包含了测序计数的碱基，这些数据文件通常是以FASTQ文件的格式存在。处理这些FASTQ文件最常见的第一步操作就是将测序读长回贴到已知的转录组上（或已经注释的基因组上），将每个测序读长转换为一个或多个基因组坐标。...
RNA-seq综述（四）
对于真核基因组中的常规RNA-seq DGE分析来说，一般认为每个样本需要100万-300万条读长（也就是我们常说的10M到30M数量）。但是，在多个物种中的实验结果显示当每个样本的测序读长数量为1M时，那么这个数量级的测序读长提供的转录本丰度信息与转录组中表达最高表达量的一半的转录本30M测序提供的丰度信息类似。...
转录组高通量测序
RNA研究 六、 有参考基因组的转录组分析（Transcriptome analysis with reference genome） > 测序和基本数据处理 合成双链Cdna 酶切去POLY-A 两端连接454接头 454测序 基本数据处理（图像识别、碱基识别、过滤接头序列、检测可能的样本污染） > 生物信息分析内容 * 测序数据产量及与Reference比对结果概述...
T/CHIA 21.3-2021 中可能用到的仪器设备
色谱自动进样器（多功能）
拉曼光谱仪
电镜制样设备
制备液相/层析纯化
其它光学测量仪
其他试验机
超低温冰箱
组织处理仪
匀浆机/组织破碎
离心机
均质器 /匀浆机/乳化机
移液工作站/智能化样品处理平台/全自动稀释配标仪
冻干机/冷冻干燥机
液氮罐
文库制备系统
单细胞分离分析/克隆筛选
核酸纯化系统/核酸提取仪
细胞分离/提取仪
微量分光光度计
其它生物工程设备
植物荧光成像仪
细胞成像/活细胞成像
细胞破碎仪
蛋白质纯化系统
基因/DNA测序仪
采血设备
摇床振荡孵育器
蛋白印迹仪/转印仪
蛋白/肽测序仪
活体成像
细胞培养生化分析仪/细胞分析仪
基因导入仪/电穿孔仪
集菌仪﹑无菌过滤器
其它行业专用
其他包装业专用