RSAM-07 长非编码RNA研究：lncRNA预测

lncRNA是一类转录本长度超过200个核苷酸的RNA分子的总称。lncRNA的表达水平相对于编码蛋白的基因一般比较低，说明lncRNA可能主要起调控作用。在基因组上，一般lncRNA附近会有编码蛋白基因，即使是intergenic（基因间）lncRNA，也大概有一半左右位于编码蛋白基因10kb范围内。根据lncRNA在基因组上的位置，一个lncRNA可以归于以下五类中的一种或五种：（1）sense（2） antisense（3）bidirectional（4）intronic（5）intergenic。 
 

本方案将针对RNA-Seq测序数据进行深度挖掘，识别符合功能意义的lncRNA转录序列。基于RNA-Seq数据，我们首先预测非编码蛋白的lncRNA; 其次，计算lncRNA表达量及其分组内的差异表达。 
 

图例 lncRNA预测与序列结构定义 
 

图例 lncRNA表达量计算与差异表达分析 

 

更多详情： http://www.biogenius.cn/htm/products/transcriptome/lncRNAseq/analysis/33.html

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